Tóm tắt Công văn 1559/TCT-CS năm 2024 về chính sách thuế giá trị gia tăng

Công văn 1559/TCT-CS do Tổng cục Thuế ban hành năm 2024 là văn bản hướng dẫn nghiệp vụ quan trọng gửi đến các Cục Thuế địa phương nhằm giải quyết các vướng mắc liên quan đến chính sách thuế giá trị gia tăng (GTGT), đặc biệt là công tác khấu trừ và hoàn thuế GTGT đối với các dự án đầu tư. Dưới đây là nội dung chi tiết và các hướng dẫn cốt lõi từ Tổng cục Thuế.

1. Phạm vi áp dụng và đối tượng hướng dẫn

Văn bản tập trung tháo gỡ khó khăn cho doanh nghiệp và thống nhất cách áp dụng pháp luật thuế GTGT trên toàn quốc đối với các trường hợp sau:

• Xác định điều kiện hoàn thuế GTGT đối với dự án đầu tư mới hoặc dự án đầu tư mở rộng của cơ sở kinh doanh.
• Hướng dẫn phương thức kê khai, bù trừ số thuế GTGT đầu vào của dự án đầu tư với hoạt động sản xuất kinh doanh đang thực hiện.
• Phân định quyền hạn và nghĩa vụ kê khai thuế giữa trụ sở chính của doanh nghiệp và chi nhánh trực thuộc trực tiếp quản lý dự án đầu tư.

2. Điều kiện và nguyên tắc hoàn thuế GTGT đối với dự án đầu tư

Tổng cục Thuế nhấn mạnh các nguyên tắc pháp lý cốt lõi để doanh nghiệp được xét hoàn thuế GTGT cho dự án đầu tư:

• Dự án đầu tư phải được thực hiện theo đúng tiến độ quy định tại Giấy chứng nhận đăng ký đầu tư hoặc Quyết định chủ trương đầu tư của cơ quan nhà nước có thẩm quyền.
• Cơ sở kinh doanh đang hoạt động có dự án đầu tư mới tại cùng tỉnh, thành phố hoặc khác tỉnh, thành phố nơi đóng trụ sở chính phải thực hiện kê khai riêng cho dự án đầu tư.
• Số thuế GTGT đầu vào lũy kế của hàng hóa, dịch vụ mua vào dùng cho dự án đầu tư chưa được khấu trừ hết từ 300 triệu đồng trở lên thì được xem xét hoàn thuế GTGT.

3. Phương pháp kê khai và bù trừ thuế GTGT

Để đảm bảo tính chính xác trong việc xác định số thuế được hoàn, quy trình kê khai và bù trừ được hướng dẫn như sau:

• Doanh nghiệp phải thực hiện bù trừ số thuế GTGT đầu vào của dự án đầu tư với số thuế GTGT phải nộp của hoạt động sản xuất kinh doanh đang thực hiện tại trụ sở chính trước khi xác định số thuế được hoàn.
• Sau khi bù trừ, nếu số thuế GTGT đầu vào của dự án đầu tư chưa được khấu trừ hết vẫn đạt từ 300 triệu đồng trở lên thì doanh nghiệp mới được lập hồ sơ đề nghị hoàn thuế GTGT cho dự án đầu tư.
• Hóa đơn, chứng từ mua vào phục vụ dự án đầu tư phải đảm bảo tính hợp pháp, hợp lệ và thanh toán không dùng tiền mặt đối với các hóa đơn từ 20 triệu đồng trở lên.

4. Các trường hợp không được hoàn thuế GTGT đối với dự án đầu tư

Tổng cục Thuế lưu ý cơ quan thuế các cấp kiểm tra chặt chẽ để loại trừ các trường hợp không được hoàn thuế theo quy định:

• Dự án đầu tư của cơ sở kinh doanh không góp đủ vốn điều lệ như đã đăng ký theo quy định của pháp luật về doanh nghiệp.
• Dự án đầu tư của cơ sở kinh doanh ngành, nghề đầu tư kinh doanh có điều kiện nhưng chưa đáp ứng đủ điều kiện kinh doanh theo quy định của Luật Đầu tư.
• Dự án đầu tư khai thác tài nguyên, khoáng sản được cấp phép từ ngày 01/7/2016 hoặc dự án đầu tư sản xuất sản phẩm hàng hóa mà tổng trị giá tài nguyên, khoáng sản cộng với chi phí năng lượng chiếm từ 51% giá thành sản phẩm trở lên.

5. Hướng dẫn tổ chức thực hiện cho cơ quan thuế địa phương

Nhằm nâng cao hiệu quả quản lý thuế và hỗ trợ người nộp thuế tối đa, Tổng cục Thuế yêu cầu:

• Cục Thuế các tỉnh, thành phố trực thuộc Trung ương chủ động rà soát, đối chiếu hồ sơ thực tế của doanh nghiệp với các quy định pháp luật hiện hành để giải quyết hoàn thuế kịp thời, đúng đối tượng.
• Tăng cường công tác thanh tra, kiểm tra trước và sau hoàn thuế nhằm phát hiện, ngăn chặn và xử lý nghiêm các hành vi gian lận hóa đơn, trục lợi tiền hoàn thuế từ ngân sách nhà nước.
• Tuyên truyền, hướng dẫn người nộp thuế thực hiện đúng các thủ tục kê khai bổ sung khi có sự thay đổi về quy mô, tiến độ hoặc thông tin pháp lý của dự án đầu tư.