Công văn 2351/TCT-CS được Tổng cục Thuế ban hành ngày 30 tháng 05 năm 2016 nhằm hướng dẫn về chính sách thuế thu nhập doanh nghiệp (TNDN), trọng tâm là việc giải quyết các vướng mắc liên quan đến ưu đãi thuế đối với dự án đầu tư mở rộng. Văn bản này đóng vai trò quan trọng trong việc định hướng cho các doanh nghiệp và cơ quan thuế địa phương thực hiện đúng quy định pháp luật thuế TNDN qua các thời kỳ, đảm bảo quyền lợi hợp pháp của người nộp thuế trong giai đoạn chuyển tiếp chính sách.

• Nguyên tắc áp dụng ưu đãi thuế TNDN đối với dự án đầu tư mở rộng:
  • Doanh nghiệp có dự án đầu tư phát triển dự án đang hoạt động (đầu tư mở rộng) thuộc lĩnh vực hoặc địa bàn ưu đãi thuế TNDN theo quy định của Luật thuế TNDN số 32/2013/QH13 và các văn bản hướng dẫn thi hành thì được lựa chọn hưởng ưu đãi thuế.
  • Đối với các dự án đầu tư mở rộng được thực hiện trong giai đoạn từ năm 2009 đến năm 2013 (giai đoạn Luật thuế TNDN năm 2008 không cho phép hưởng ưu đãi thuế TNDN đối với đầu tư mở rộng), nếu đáp ứng các điều kiện ưu đãi theo quy định tại Luật số 32/2013/QH13 thì được hưởng ưu đãi thuế TNDN cho thời gian còn lại kể từ kỳ tính thuế năm 2014.
• Điều kiện tiêu chuẩn để dự án đầu tư mở rộng được hưởng ưu đãi:
  • Dự án phải đáp ứng một trong các tiêu chí về quy mô vốn đầu tư tối thiểu, hoặc tiêu chí về tăng công suất thiết kế, hoặc tiêu chí về công nghệ sản xuất theo quy định của pháp luật thuế hiện hành tại thời điểm áp dụng.
  • Nguyên giá tài sản cố định tăng thêm khi dự án đầu tư mở rộng hoàn thành đi vào hoạt động phải đạt mức tối thiểu theo quy định của Chính phủ và Bộ Tài chính trong từng thời kỳ.
  • Doanh nghiệp phải thực hiện chế độ kế toán, hóa đơn, chứng từ và nộp thuế theo kê khai, đồng thời phải hạch toán riêng phần thu nhập từ hoạt động đầu tư mở rộng để áp dụng ưu đãi thuế tương ứng.
• Phương thức lựa chọn áp dụng ưu đãi của doanh nghiệp:
  • Doanh nghiệp được quyền lựa chọn hưởng ưu đãi thuế TNDN theo dự án đang hoạt động cho thời gian còn lại (bao gồm cả mức thuế suất ưu đãi và thời gian miễn, giảm thuế nếu có) nếu dự án đang hoạt động vẫn trong thời gian được hưởng ưu đãi.
  • Hoặc doanh nghiệp có thể lựa chọn áp dụng thời gian miễn thuế, giảm thuế đối với phần thu nhập tăng thêm do đầu tư mở rộng mang lại (không được hưởng thuế suất ưu đãi) với thời gian miễn, giảm bằng với thời gian miễn, giảm thuế áp dụng đối với dự án đầu tư mới trên cùng địa bàn hoặc lĩnh vực ưu đãi.
• Hướng dẫn phân bổ thu nhập đối với trường hợp không hạch toán riêng được:
  • Trường hợp doanh nghiệp có dự án đầu tư mở rộng nhưng không hạch toán riêng được phần thu nhập tăng thêm từ hoạt động này, thu nhập từ hoạt động đầu tư mở rộng được xác định theo tỷ lệ giữa nguyên giá tài sản cố định đầu tư mới đưa vào sử dụng cho sản xuất kinh doanh trên tổng nguyên giá tài sản cố định của doanh nghiệp.
  • Phương pháp phân bổ này đảm bảo tính khách quan, minh bạch và tránh việc chuyển dịch lợi nhuận giữa các hoạt động được ưu đãi và không được ưu đãi thuế trong cùng một pháp nhân.

Công văn 2351/TCT-CS giúp làm rõ quyền lợi của doanh nghiệp có hoạt động đầu tư mở rộng trong giai đoạn chuyển tiếp giữa các Luật thuế TNDN. Doanh nghiệp cần chủ động rà soát các điều kiện thực tế của dự án đầu tư, thực hiện lưu trữ hồ sơ pháp lý, chứng từ kế toán và chứng minh việc đáp ứng các tiêu chí kỹ thuật/vốn để bảo vệ quyền lợi tối đa khi quyết toán thuế TNDN với cơ quan quản lý trực tiếp.