Công văn 245/TCT-KK do Tổng cục Thuế ban hành hướng dẫn về công tác khấu trừ và hoàn thuế giá trị gia tăng (GTGT), nhằm tháo gỡ các vướng mắc của doanh nghiệp và cơ quan thuế địa phương trong quá trình thực hiện nghĩa vụ thuế và giải quyết hồ sơ hoàn thuế GTGT.

Văn bản áp dụng đối với các cơ quan thuế các cấp (Cục Thuế các tỉnh, thành phố trực thuộc Trung ương) và các người nộp thuế (doanh nghiệp, tổ chức) có phát sinh hoạt động khai thuế, khấu trừ thuế và đề nghị hoàn thuế GTGT, đặc biệt là đối với các dự án đầu tư.

• Thuế GTGT đầu vào của hàng hóa, dịch vụ dùng cho sản xuất, kinh doanh hàng hóa, dịch vụ chịu thuế GTGT được khấu trừ toàn bộ, kể cả thuế GTGT đầu vào không được bồi thường của hàng hóa dịch vụ chịu thuế GTGT bị tổn thất.
• Doanh nghiệp phải đáp ứng đầy đủ các điều kiện về hóa đơn GTGT hợp pháp, chứng từ thanh toán không dùng tiền mặt đối với hàng hóa, dịch vụ mua vào có giá trị từ 20 triệu đồng trở lên theo quy định hiện hành.

• Cơ sở kinh doanh mới thành lập từ dự án đầu tư đã đăng ký kinh doanh, đăng ký nộp thuế GTGT theo phương pháp khấu trừ, hoặc dự án đầu tư mới của cơ sở kinh doanh đang hoạt động thuộc đối tượng được xét hoàn thuế GTGT nếu có số thuế GTGT đầu vào lũy kế chưa được khấu trừ hết theo quy định của pháp luật về thuế GTGT.
• Việc hoàn thuế GTGT đối với dự án đầu tư phải tuân thủ nghiêm ngặt các điều kiện về vốn điều lệ đã góp đủ, giấy phép ngành nghề kinh doanh có điều kiện (nếu có), và tiến độ thực hiện dự án đầu tư theo đúng phê duyệt của cơ quan nhà nước có thẩm quyền.

• Trường hợp dự án đầu tư kết thúc để đi vào hoạt động sản xuất kinh doanh, người nộp thuế thực hiện kết chuyển số thuế GTGT đầu vào chưa được hoàn của dự án đầu tư để bù trừ với số thuế GTGT phải nộp của hoạt động sản xuất kinh doanh đang thực hiện.
• Thủ tục kết chuyển và kê khai phải được thực hiện trên tờ khai thuế GTGT của kỳ tính thuế tương ứng theo đúng hướng dẫn tại Thông tư số 80/2021/TT-BTC của Bộ Tài chính.

• Tổng cục Thuế yêu cầu các Cục Thuế địa phương thực hiện phân loại hồ sơ hoàn thuế GTGT theo đúng quy trình (hoàn thuế trước kiểm tra sau hoặc kiểm tra trước hoàn thuế sau) nhằm phát hiện và ngăn chặn kịp thời các hành vi gian lận, trục lợi tiền hoàn thuế từ ngân sách nhà nước.
• Đối với các hồ sơ hoàn thuế có dấu hiệu rủi ro cao hoặc sử dụng hóa đơn không hợp pháp, cơ quan thuế cần phối hợp chặt chẽ với các cơ quan chức năng để xác minh, làm rõ trước khi quyết định hoàn thuế cho doanh nghiệp.

Công văn 245/TCT-KK có hiệu lực hướng dẫn thi hành kể từ ngày ban hành. Các cơ quan thuế địa phương và người nộp thuế có trách nhiệm căn cứ vào các nội dung hướng dẫn tại văn bản này và các quy định pháp luật liên quan để thực hiện thống nhất, đúng quy định.