Công văn 3396/TCT-DNL được Tổng cục Thuế ban hành năm 2015 nhằm hướng dẫn công tác kê khai tập trung thuế giá trị gia tăng (GTGT) tại Hội sở chính của các doanh nghiệp, tổ chức tài chính quy mô lớn. Đây là văn bản hướng dẫn nghiệp vụ quan trọng giúp thống nhất phương thức quản lý thuế, giảm thiểu thủ tục hành chính cho doanh nghiệp có hệ thống chi nhánh trải dài trên nhiều tỉnh, thành phố.

Đối tượng và phạm vi áp dụng kê khai thuế GTGT tập trung

• Áp dụng đối với các doanh nghiệp lớn, đặc biệt là các ngân hàng thương mại, tổ chức tín dụng hoặc tập đoàn có mô hình hoạt động thống nhất, hạch toán tập trung tại Hội sở chính.
• Các chi nhánh, đơn vị trực thuộc hạch toán phụ thuộc không trực tiếp thực hiện kê khai thuế GTGT riêng lẻ mà số liệu doanh thu, chi phí sẽ được tổng hợp về Hội sở chính để thực hiện nghĩa vụ thuế.

Phương thức kê khai và phân bổ nghĩa vụ thuế GTGT

• Kê khai tại Hội sở chính: Doanh nghiệp thực hiện lập tờ khai thuế GTGT chung cho toàn bộ hoạt động sản xuất kinh doanh của cả Hội sở chính và các đơn vị trực thuộc hạch toán phụ thuộc. Tờ khai này được nộp trực tiếp cho cơ quan thuế quản lý trực tiếp Hội sở chính (Vụ Quản lý thuế doanh nghiệp lớn hoặc Cục Thuế tỉnh, thành phố liên quan).
• Nguyên tắc phân bổ thuế cho địa phương: Xác định nghĩa vụ thuế GTGT phải nộp tại từng địa phương nơi có chi nhánh hạch toán phụ thuộc. Việc phân bổ này tuân thủ theo tỷ lệ doanh thu hoặc theo quy định cụ thể tại các văn bản quy phạm pháp luật về thuế hiện hành (như Thông tư 156/2013/TT-BTC).
• Nộp thuế vào ngân sách: Sau khi xác định số thuế phân bổ, doanh nghiệp lập chứng từ nộp tiền vào ngân sách nhà nước cho các địa phương nơi có chi nhánh hoạt động để đảm bảo quyền lợi nguồn thu của từng địa phương.

Trách nhiệm của các bên liên quan

• Đối với người nộp thuế (Doanh nghiệp): Có trách nhiệm thu thập, đối chiếu và tổng hợp đầy đủ hóa đơn, chứng từ mua vào, bán ra từ các chi nhánh phụ thuộc. Đảm bảo tính chính xác của số liệu phân bổ thuế và thực hiện nộp thuế đúng thời hạn quy định để tránh phát sinh nợ thuế tại các địa phương.
• Đối với cơ quan thuế quản lý trực tiếp: Chịu trách nhiệm tiếp nhận, kiểm tra hồ sơ khai thuế tập trung của doanh nghiệp; giám sát việc phân bổ và truyền dữ liệu thông tin nộp thuế cho cơ quan thuế địa phương nơi có chi nhánh của doanh nghiệp để phối hợp quản lý.

Ý nghĩa thực tiễn của văn bản

Công văn 3396/TCT-DNL giúp tạo điều kiện thuận lợi cho các doanh nghiệp lớn tối ưu hóa quy trình kế toán, giảm bớt đầu mối làm việc với cơ quan thuế tại địa phương. Đồng thời, văn bản cũng giúp cơ quan thuế kiểm soát chặt chẽ dòng thuế GTGT đầu vào, đầu ra của toàn hệ thống doanh nghiệp, hạn chế tối đa việc sai lệch số liệu giữa các đơn vị thành viên.