Tổng cục Thuế nhận được công văn số 113/04/20/JCV-CV ngày 16/04/2020 của Công ty TNHH Japfa Comfeed Việt Nam về hoàn thuế thu nhập doanh nghiệp (TNDN). Tại công văn số 113/04/20/JCV-CV, Công ty TNHH Japfa Comfeed Việt Nam có trình bày như sau:

Tại công văn số 8424/CT-TTKT2 ngày 01/11/2019 của Cục Thuế tỉnh Bình Thuận trả lời Công ty TNHH Japfa Comfeed có nội dung như sau:

“Mặt khác, theo hồ sơ mà Công ty TNHH Japfa Comfeed Việt Nam gửi kèm theo Công văn số 261/10/19/CV-Ja ngày 23/10/2019 thì tại Biên bản kiểm tra Quyết toán thuế để sáp nhập Công ty TNHH Japfa Comfeed Bình Thuận - Chi nhánh Bình Dương do phòng Kiểm tra thuế số 3-Cục Thuế tỉnh Bình Dương lập, có ghi phần ý kiến của doanh nghiệp như sau:

- Công ty chúng tôi không đồng ý với Biên bản kiểm tra thuế từ kết quả của Đoàn kiểm tra thuế số 3: “về việc truy thu thuế TNDN năm 2013-2014-2015-2016: 515.900.776 đồng.

…

Như vậy căn cứ trích dẫn những quy định nêu trên Công ty chúng tôi không đồng ý ghi nhận doanh thu tính thuế TNDN đối với trường hợp xuất hàng tiêu dùng nội bộ cũng như không phải tính và nộp thuế TNDN đối với doanh thu nội bộ tiếp tục quá trình sản xuất.

…

Tạm thời, Công ty chúng tôi sẽ tạm nộp trước các khoản truy thu thuế và xử phạt theo kiến nghị từ Đoàn kiểm tra thuế số 3. Trường hợp có hướng dẫn thuộc thẩm quyền giải quyết của Cục Thuế tỉnh Bình Dương hay Tổng cục Thuế khác với hướng dẫn của Đoàn kiểm tra thuế số 3 thì Đoàn kiểm tra phải hoàn trả những khoản tiền truy thu, xử phạt cùng với khoản tiền lãi mà chúng tôi đã vay ngân hàng đó nộp cho khoản truy thu này.”

Ngày 7/7/2020, Tổng cục Thuế đã có công văn số 2756/TCT-CS gửi Công ty TNHH Japfa Comfeed Việt Nam và Cục Thuế tỉnh Vĩnh Phúc, trong đó có nêu: “Trường hợp doanh nghiệp có luân chuyển hàng hóa giữa các chi nhánh hạch toán phụ thuộc để tiếp tục quá trình sản xuất của doanh nghiệp thì doanh nghiệp phải tính riêng thu nhập của chi nhánh được hưởng ưu đãi thuế thu nhập doanh nghiệp, trong đó doanh thu để tính thuế không bao gồm doanh thu luân chuyển nội bộ của doanh nghiệp, việc ghi nhận chi phí được trừ phải tương ứng với doanh thu tính thuế.”

Đề nghị Cục Thuế tỉnh Bình Thuận và Cục Thuế tỉnh Bình Dương phối hợp xử lý vướng mắc của Công ty Liên quan đến xác định thuế TNDN phải nộp, đã nộp tại Bình Thuận, Bình Dương và báo cáo kết quả xử lý về Tổng cục Thuế./.