Tổng cục Thuế nhận được công văn số 4143/BGTVT-QLDN ngày 19/4/2018 của Bộ Giao thông vận tải, công văn số 13099/CT-KTT3 ngày 30/3/2018 của Cục Thuế TP Hà Nội, công văn số 882/VEC-TCKT ngày 04/4/2018 và công văn số 572/VEC-TCKT ngày 09/3/2018 của Tổng công ty Đầu tư phát triển đường cao tốc Việt Nam về hoàn thuế GTGT đối với dự án đầu tư. Về vấn đề này, Tổng cục Thuế có ý kiến như sau:

1. Về chính sách thuế GTGT

Từ ngày 01/7/2016, việc hoàn thuế GTGT thực hiện theo quy định tại Luật số 106/2016/QH13 ngày 06/4/2016 của Quốc hội, Nghị định 100/2016/NĐ-CP ngày 01/7/2016 của Chính phủ và Thông tư số 130/2016/TT-BTC ngày 12/8/2016 của Bộ Tài chính.

2. Về việc xác định vốn điều lệ của VEC

Tại công văn số 1245/CP-ĐMDN ngày 01/9/2004 của Chính phủ về việc thành lập Công ty Đầu tư phát triển đường cao tốc Việt Nam (VEC) thì vốn điều lệ của VEC là 1.000 tỷ đồng.

Tuy nhiên, Bộ Giao thông vận tải có Quyết định số 1666/QĐ-BGTVT ngày 17/6/2010 thành lập Công ty mẹ Tổng công ty Đầu tư và phát triển đường cao tốc Việt Nam với vốn điều lệ là 1.018,79 tỷ đồng dẫn đến thiếu vốn điều lệ là 18,79 tỷ đồng.

Ngày 22/6/2018, Tổng cục Thuế đã có công văn số 2517/TCT-CS gửi Bộ Giao thông vận tải đề nghị nêu rõ lý do điều chỉnh vốn điều lệ của Tổng công ty Đầu tư phát triển đường cao tốc Việt Nam tăng từ 1.000 tỷ đồng lên 1.018,79 tỷ đồng (tăng thêm 18,79 tỷ đồng so với mức vốn điều lệ quy định tại công văn số 1245/CP-ĐMDN của Chính phủ) dẫn đến thiếu 18,79 tỷ đồng vốn điều lệ. Tuy nhiên, Bộ Giao thông vận tải chưa có văn bản phúc đáp.

Do đó, Cục Thuế TP Hà Nội căn cứ tình hình thực tế và các quy định về thuế GTGT để xử lý theo quy định.

Tổng cục Thuế có ý kiến để Cục Thuế thành phố Hà Nội, Tổng công ty Đầu tư phát triển đường cao tốc Việt Nam được biết./.