Công văn 4646/TCT-CS do Tổng cục Thuế ban hành năm 2024 là văn bản hướng dẫn nghiệp vụ quan trọng, nhằm giải quyết các vướng mắc thực tế của người nộp thuế và cơ quan thuế địa phương. Văn bản này đóng vai trò định hướng, thống nhất cách áp dụng các quy định pháp luật về thuế, đảm bảo tính minh bạch và đồng bộ trong quá trình thực thi nghĩa vụ tài chính đối với ngân sách nhà nước.

• Nguyên tắc áp dụng chính sách thuế giá trị gia tăng (GTGT): Hướng dẫn chi tiết về điều kiện khấu trừ thuế GTGT đầu vào đối với các hóa đơn mua vào của doanh nghiệp. Làm rõ các trường hợp hàng hóa, dịch vụ dùng cho hoạt động sản xuất kinh doanh chịu thuế và không chịu thuế, cũng như hồ sơ chứng từ bắt buộc để được hoàn thuế GTGT theo đúng quy định pháp luật.
• Xác định chi phí hợp lý khi tính thuế thu nhập doanh nghiệp (TNDN): Làm rõ các khoản chi phí được trừ và không được trừ khi xác định thu nhập chịu thuế TNDN. Đặc biệt lưu ý đến tính hợp pháp, hợp lệ của hóa đơn, chứng từ thanh toán không dùng tiền mặt đối với các giao dịch có giá trị lớn, và các khoản chi phí phúc lợi, quảng cáo, khuyến mại.
• Quản lý và sử dụng hóa đơn điện tử: Nhấn mạnh trách nhiệm của người nộp thuế trong việc khởi tạo, phát hành và báo cáo tình hình sử dụng hóa đơn điện tử. Hướng dẫn phương án xử lý đối với các trường hợp hóa đơn điện tử có sai sót, hóa đơn bị lập sai thời điểm hoặc hóa đơn liên quan đến các doanh nghiệp có rủi ro cao về thuế.

• Tính đồng bộ và thống nhất: Các Cục Thuế tỉnh, thành phố trực thuộc Trung ương có trách nhiệm căn cứ vào nội dung hướng dẫn tại Công văn này để áp dụng nhất quán cho các trường hợp tương tự tại địa phương, tránh việc giải thích luật thiếu thống nhất gây khó khăn cho người nộp thuế.
• Tăng cường công tác hậu kiểm: Cơ quan thuế tập trung thanh tra, kiểm tra dựa trên nguyên tắc quản lý rủi ro, đối chiếu kỹ lưỡng thông tin trên hệ thống cơ sở dữ liệu hóa đơn điện tử để kịp thời phát hiện và xử lý các hành vi gian lận, trốn thuế.

Doanh nghiệp và cá nhân kinh doanh cần chủ động rà soát lại hệ thống chứng từ, sổ sách kế toán và tình hình sử dụng hóa đơn của đơn vị mình đối chiếu với các hướng dẫn tại Công văn 4646/TCT-CS. Việc chủ động tự phát hiện và khắc phục các sai sót về kê khai thuế sẽ giúp doanh nghiệp giảm thiểu tối đa các khoản phạt chậm nộp và rủi ro pháp lý không đáng có trong quá trình quyết toán thuế.