Công văn 48764/CT-HTr do Cục Thuế thành phố Hà Nội ban hành năm 2016 hướng dẫn về chính sách thuế liên quan đến việc nộp tiền sử dụng đất của các tổ chức, doanh nghiệp trên địa bàn. Đây là văn bản hướng dẫn nghiệp vụ quan trọng giúp tháo gỡ các vướng mắc về nghĩa vụ tài chính đất đai, hạch toán chi phí được trừ khi tính thuế thu nhập doanh nghiệp (TNDN) và các thủ tục hồ sơ liên quan.

- Đối tượng và nghĩa vụ nộp tiền sử dụng đất

• Các tổ chức kinh tế, hộ gia đình, cá nhân được Nhà nước giao đất có thu tiền sử dụng đất phải thực hiện nộp tiền sử dụng đất đầy đủ vào ngân sách nhà nước theo đúng thông báo của cơ quan thuế.
• Thời hạn nộp tiền sử dụng đất được thực hiện theo quy định tại Nghị định số 45/2014/NĐ-CP của Chính phủ. Việc chậm nộp tiền sử dụng đất sẽ bị tính tiền chậm nộp theo quy định của Luật Quản lý thuế hiện hành.

- Hạch toán tiền sử dụng đất vào chi phí được trừ khi tính thuế TNDN

• Tiền sử dụng đất được phân bổ vào chi phí được trừ khi xác định thu nhập chịu thuế TNDN phải đáp ứng điều kiện có đủ hóa đơn, chứng từ hợp pháp theo quy định của pháp luật.
• Trường hợp doanh nghiệp được Nhà nước giao đất có thu tiền sử dụng đất để thực hiện dự án đầu tư xây dựng nhà ở để bán hoặc cho thuê, tiền sử dụng đất nộp vào ngân sách nhà nước được tính vào chi phí giá vốn của bất động sản chuyển nhượng tương ứng.
• Đối với đất sử dụng lâu dài, giá trị quyền sử dụng đất không được trích khấu hao tài sản cố định vào chi phí được trừ khi xác định thu nhập chịu thuế TNDN theo quy định tại Thông tư số 45/2013/TT-BTC và các văn bản sửa đổi, bổ sung.

- Hồ sơ, chứng từ chứng minh nghĩa vụ nộp tiền sử dụng đất

• Hồ sơ xác định nghĩa vụ tài chính về đất đai bao gồm: Quyết định giao đất của cơ quan nhà nước có thẩm quyền, Phiếu chuyển thông tin địa chính để xác định nghĩa vụ tài chính, Thông báo nộp tiền sử dụng đất của cơ quan thuế.
• Chứng từ nộp tiền vào ngân sách nhà nước (giấy nộp tiền vào ngân sách bằng tiền mặt hoặc chuyển khoản) là căn cứ pháp lý cao nhất để xác nhận doanh nghiệp đã hoàn thành nghĩa vụ tài chính đối với Nhà nước.
• Trường hợp có sự thay đổi về quy hoạch hoặc diện tích đất dẫn đến thay đổi tiền sử dụng đất phải nộp, doanh nghiệp phải thực hiện kê khai bổ sung và nộp phần chênh lệch theo thông báo điều chỉnh của cơ quan thuế.

- Chính sách miễn, giảm tiền sử dụng đất và ưu đãi thuế liên quan

• Doanh nghiệp thuộc đối tượng được miễn, giảm tiền sử dụng đất theo quy định của pháp luật về đất đai phải thực hiện thủ tục xin miễn, giảm tại cơ quan thuế trực tiếp quản lý trước khi có thông báo nộp tiền.
• Số tiền sử dụng đất được miễn, giảm không được tính vào chi phí được trừ khi xác định thu nhập chịu thuế TNDN, do doanh nghiệp không thực tế chi trả khoản tiền này.