Công văn 5234/TCT/NV6 do Tổng cục Thuế ban hành hướng dẫn về việc xử lý các trường hợp kê khai chậm thuế giá trị gia tăng (GTGT) đầu vào của doanh nghiệp. Văn bản này nhằm tháo gỡ vướng mắc và thống nhất phương án giải quyết cho các cơ sở kinh doanh trong việc thực hiện khấu trừ thuế GTGT đối với các hóa đơn mua hàng hóa, dịch vụ bị bỏ sót hoặc chuyển chậm.

Đối tượng và phạm vi áp dụng

Hướng dẫn tại văn bản này áp dụng đối với các tổ chức, cá nhân nộp thuế GTGT theo phương pháp khấu trừ có phát sinh hóa đơn GTGT mua vào nhưng không thực hiện kê khai kịp thời trong kỳ tính thuế phát sinh.

Quy định về thời hạn kê khai và khấu trừ thuế GTGT đầu vào

• Theo nguyên tắc chung, hóa đơn GTGT mua vào phát sinh trong tháng nào thì cơ sở kinh doanh phải thực hiện kê khai, khấu trừ khi xác định số thuế GTGT phải nộp của tháng đó.
• Đối với các trường hợp có lý do khách quan (như chậm chuyển hóa đơn, chứng từ từ bên bán sang bên mua, thất lạc trong quá trình vận chuyển nhưng sau đó tìm thấy), doanh nghiệp được phép kê khai khấu trừ bổ sung vào các kỳ tính thuế tiếp theo.
• Thời hạn tối đa cho phép kê khai chậm để được khấu trừ thuế GTGT đầu vào là không quá 03 tháng kể từ tháng phát sinh hóa đơn mua vào. Mọi trường hợp kê khai sau thời hạn 03 tháng này đều không được chấp nhận khấu trừ thuế GTGT đầu vào.

Xử lý đối với hóa đơn GTGT đầu vào kê khai quá thời hạn quy định

• Các hóa đơn GTGT đầu vào kê khai chậm quá thời hạn 03 tháng sẽ bị loại khỏi số thuế GTGT được khấu trừ trong kỳ.
• Khoản thuế GTGT đầu vào không được khấu trừ do kê khai chậm quá thời hạn nêu trên sẽ được tính vào chi phí hợp lý khi xác định thu nhập chịu thuế thu nhập doanh nghiệp (TNDN) hoặc được hạch toán vào nguyên giá tài sản cố định, giá trị vật tư, hàng hóa mua vào tùy theo từng trường hợp cụ thể theo quy định của pháp luật về thuế TNDN và chế độ kế toán hiện hành.

Yêu cầu về hồ sơ, thủ tục và trách nhiệm của cơ quan thuế

• Doanh nghiệp khi thực hiện kê khai bổ sung đối với các hóa đơn chậm phải chuẩn bị văn bản giải trình rõ ràng về nguyên nhân khách quan dẫn đến việc chậm trễ kê khai.
• Hóa đơn GTGT dùng để kê khai chậm phải đảm bảo tính hợp pháp, hợp lệ, có đầy đủ chữ ký, con dấu và thông tin của các bên tham gia giao dịch.
• Cơ quan thuế quản lý trực tiếp có trách nhiệm thanh tra, kiểm tra và đối chiếu thông tin hóa đơn kê khai chậm với cơ quan thuế quản lý bên bán để ngăn chặn các hành vi gian lận, quay vòng hóa đơn hoặc khai khống hóa đơn nhằm mục đích trốn thuế.

Hiệu lực thi hành và lưu ý quan trọng khi áp dụng

Công văn 5234/TCT/NV6 mang tính chất hướng dẫn nghiệp vụ tại thời điểm ban hành dựa trên các quy định pháp luật thuế GTGT thời kỳ đó. Người nộp thuế cần lưu ý rằng, theo các quy định pháp luật thuế GTGT hiện hành (như Luật sửa đổi, bổ sung một số điều của các Luật về thuế và các Thông tư hướng dẫn của Bộ Tài chính hiện nay), quy định về thời hạn kê khai thuế GTGT đầu vào đã được nới lỏng hơn rất nhiều. Cụ thể, thuế GTGT đầu vào phát sinh trong kỳ nào được kê khai, khấu trừ khi xác định số thuế phải nộp của kỳ đó. Trường hợp phát hiện sai sót, bỏ sót thì người nộp thuế được kê khai, khấu trừ bổ sung trước khi cơ quan thuế, cơ quan có thẩm quyền công bố quyết định thanh tra, kiểm tra thuế tại trụ sở người nộp thuế.