Giới thiệu về Công văn 5416/TCT-CS năm 2018

Công văn 5416/TCT-CS do Tổng cục Thuế ban hành năm 2018 là văn bản hướng dẫn nghiệp vụ thuế quan trọng, giải đáp các vướng mắc liên quan đến chính sách hoàn thuế giá trị gia tăng (GTGT) đối với dự án đầu tư của doanh nghiệp. Văn bản này căn cứ trên các quy định pháp luật thuế hiện hành, đặc biệt là Luật số 106/2016/QH13, Nghị định số 100/2016/NĐ-CP và Thông tư số 130/2016/TT-BTC để làm rõ các điều kiện, nguyên tắc và thủ tục hoàn thuế GTGT đầu vào phát sinh trong giai đoạn đầu tư.

Các nội dung chính sách cốt lõi về hoàn thuế GTGT dự án đầu tư

Công văn tập trung làm rõ các nguyên tắc áp dụng hoàn thuế GTGT đối với dự án đầu tư mới và các trường hợp cụ thể phát sinh trong thực tế hoạt động của doanh nghiệp:

• Đối tượng được hoàn thuế GTGT: Cơ sở kinh doanh nộp thuế GTGT theo phương pháp khấu trừ có dự án đầu tư mới (bao gồm cả dự án đầu tư được chia thành nhiều giai đoạn hoặc nhiều hạng mục) đang trong giai đoạn đầu tư, chưa đi vào hoạt động sản xuất kinh doanh, nếu có số thuế GTGT đầu vào của hàng hóa, dịch vụ mua vào phục vụ cho đầu tư lũy kế từ 300 triệu đồng trở lên thì được hoàn thuế GTGT.
• Nguyên tắc bù trừ thuế GTGT: Trước khi thực hiện hoàn thuế, cơ sở kinh doanh phải thực hiện bù trừ số thuế GTGT đầu vào của dự án đầu tư với số thuế GTGT phải nộp của hoạt động sản xuất kinh doanh đang thực hiện (nếu có). Sau khi bù trừ, nếu số thuế GTGT đầu vào còn lại của dự án đầu tư từ 300 triệu đồng trở lên thì mới được xét hoàn thuế GTGT cho dự án đầu tư.
• Khai thuế GTGT riêng cho dự án đầu tư: Doanh nghiệp phải thực hiện kê khai thuế GTGT riêng đối với dự án đầu tư theo mẫu tờ khai dành riêng cho dự án đầu tư (Mẫu số 02/GTGT). Việc kê khai này phải tách biệt với hoạt động sản xuất kinh doanh thông thường (Mẫu số 01/GTGT).

Các trường hợp không được hoàn thuế GTGT đối với dự án đầu tư

Tổng cục Thuế nhấn mạnh các trường hợp không áp dụng hoàn thuế GTGT đối với dự án đầu tư nhằm đảm bảo tính chặt chẽ trong quản lý thuế:

• Chưa góp đủ vốn điều lệ: Dự án đầu tư của cơ sở kinh doanh không được hoàn thuế GTGT nếu cơ sở kinh doanh đó chưa góp đủ số vốn điều lệ như đã đăng ký theo quy định của pháp luật. Đây là điều kiện tiên quyết để xét duyệt hồ sơ hoàn thuế.
• Dự án đầu tư của ngành nghề kinh doanh có điều kiện chưa đáp ứng đủ điều kiện: Trường hợp dự án đầu tư thuộc ngành, nghề đầu tư kinh doanh có điều kiện nhưng cơ sở kinh doanh chưa được cấp giấy phép kinh doanh ngành, nghề có điều kiện, chưa được cấp giấy chứng nhận đủ điều kiện kinh doanh hoặc chưa có văn bản chấp thuận của cơ quan nhà nước có thẩm quyền thì không được hoàn thuế GTGT.
• Dự án khai thác tài nguyên, khoáng sản: Dự án đầu tư khai thác tài nguyên, khoáng sản được cấp phép từ ngày 01/7/2016 hoặc dự án đầu tư sản xuất sản phẩm hàng hóa mà tổng trị giá tài nguyên, khoáng sản cộng với chi phí năng lượng chiếm từ 51% giá thành sản phẩm trở lên theo dự án đầu tư thì không thuộc đối tượng được hoàn thuế GTGT.

Hướng dẫn xử lý chuyển tiếp và thủ tục hồ sơ

Công văn cũng đưa ra các chỉ dẫn cụ thể cho cơ quan thuế địa phương và doanh nghiệp trong quá trình tiếp nhận, xử lý hồ sơ hoàn thuế:

• Xử lý số thuế GTGT đầu vào khi dự án đi vào hoạt động: Trường hợp dự án đầu tư đã hoàn thành và đi vào hoạt động sản xuất kinh doanh nhưng doanh nghiệp chưa kê khai hoàn thuế GTGT trong giai đoạn đầu tư, số thuế GTGT đầu vào lũy kế chưa được hoàn sẽ được chuyển sang kỳ khai thuế của hoạt động sản xuất kinh doanh để tiếp tục khấu trừ, không thực hiện hoàn thuế theo diện dự án đầu tư nữa.
• Trách nhiệm của cơ quan thuế: Cơ quan thuế có trách nhiệm kiểm tra, đối chiếu hồ sơ hoàn thuế của doanh nghiệp, đặc biệt lưu ý kiểm tra tiến độ góp vốn điều lệ, các giấy phép con đối với ngành nghề kinh doanh có điều kiện và việc phân bổ chi phí đầu vào đúng quy định pháp luật trước khi ban hành quyết định hoàn thuế.