Công văn 565/TCT-CS năm 2020 do Tổng cục Thuế ban hành ngày 11 tháng 02 năm 2020 hướng dẫn và giải đáp các vướng mắc pháp lý về chính sách hoàn thuế giá trị gia tăng (GTGT) đối với dự án đầu tư của cơ sở kinh doanh.

- Căn cứ pháp lý thực hiện hoàn thuế GTGT dự án đầu tư

Nội dung hướng dẫn tại Công văn dựa trên hệ thống văn bản pháp luật về thuế GTGT hiện hành, bao gồm:

• Khoản 3 Điều 1 Luật số 106/2016/QH13 sửa đổi, bổ sung một số điều của Luật Thuế giá trị gia tăng, Luật Thuế tiêu thụ đặc biệt và Luật Quản lý thuế.
• Nghị định số 100/2016/NĐ-CP của Chính phủ quy định chi tiết và hướng dẫn thi hành Luật Thuế giá trị gia tăng.
• Thông tư số 219/2013/TT-BTC, Thông tư số 130/2016/TT-BTC và Thông tư số 25/2018/TT-BTC của Bộ Tài chính hướng dẫn thi hành về thuế GTGT.

- Quy định về kê khai và bù trừ thuế GTGT của dự án đầu tư

Doanh nghiệp đang hoạt động sản xuất kinh doanh thực hiện nộp thuế GTGT theo phương pháp khấu trừ, nếu có dự án đầu tư mới đang trong giai đoạn đầu tư chưa đi vào hoạt động thì thực hiện kê khai, bù trừ thuế như sau:

• Trường hợp dự án đầu tư cùng tỉnh, thành phố trực thuộc Trung ương: Doanh nghiệp thực hiện kê khai riêng thuế GTGT đầu vào của dự án đầu tư và bù trừ với số thuế GTGT phải nộp của hoạt động sản xuất kinh doanh đang thực hiện tại cùng kỳ kê khai.
• Trường hợp dự án đầu tư khác tỉnh, thành phố trực thuộc Trung ương: Cơ sở kinh doanh lập hồ sơ khai thuế GTGT riêng cho dự án đầu tư để bù trừ với số thuế GTGT phải nộp của hoạt động sản xuất kinh doanh tại trụ sở chính.

- Điều kiện xét hoàn thuế GTGT đối với dự án đầu tư

Sau khi cơ sở kinh doanh đã thực hiện bù trừ số thuế GTGT đầu vào của dự án đầu tư với số thuế GTGT phải nộp của hoạt động sản xuất kinh doanh, số thuế còn lại được xem xét hoàn thuế khi đáp ứng đủ các điều kiện:

• Số thuế GTGT đầu vào của dự án đầu tư chưa được bù trừ hết có giá trị từ 300 triệu đồng trở lên.
• Dự án đầu tư đang trong giai đoạn đầu tư, chưa đi vào hoạt động sản xuất kinh doanh và chưa phát sinh doanh thu.
• Cơ sở kinh doanh đã thực hiện góp đủ số vốn điều lệ theo đúng thời hạn đã đăng ký với cơ quan đăng ký kinh doanh.

- Các trường hợp không thuộc diện được hoàn thuế GTGT dự án đầu tư

Tổng cục Thuế nhấn mạnh các trường hợp không được hoàn thuế GTGT mà phải chuyển kỳ sau hoặc xử lý theo quy định riêng:

• Dự án đầu tư của cơ sở kinh doanh không góp đủ số vốn điều lệ như đã đăng ký ban đầu.
• Dự án đầu tư của cơ sở kinh doanh thuộc ngành, nghề đầu tư kinh doanh có điều kiện nhưng chưa đáp ứng đủ các điều kiện theo quy định của pháp luật chuyên ngành.
• Dự án đầu tư khai thác tài nguyên, khoáng sản được cấp phép từ ngày 01/7/2016 hoặc dự án sản xuất sản phẩm có tổng trị giá tài nguyên, khoáng sản cộng với chi phí năng lượng chiếm từ 51% giá thành sản phẩm trở lên.
• Dự án đầu tư đã hoàn thành, đi vào hoạt động và phát sinh doanh thu. Khi đó, số thuế GTGT đầu vào chưa hoàn hết sẽ không được xét hoàn theo diện dự án đầu tư mà phải chuyển sang kê khai, khấu trừ tiếp vào số thuế GTGT của hoạt động sản xuất kinh doanh.