Công văn 5669/TCT-CS năm 2014 do Tổng cục Thuế ban hành là văn bản hướng dẫn nghiệp vụ quan trọng nhằm giải đáp các vướng mắc và thống nhất thực hiện chính sách thuế thu nhập doanh nghiệp (TNDN). Nội dung văn bản tập trung làm rõ các quy định về điều kiện, nguyên tắc và phương thức áp dụng ưu đãi thuế TNDN đối với các dự án đầu tư của doanh nghiệp.

Nguyên tắc áp dụng ưu đãi thuế thu nhập doanh nghiệp

• Ưu đãi thuế TNDN được áp dụng đối với doanh nghiệp thực hiện chế độ kế toán, hóa đơn, chứng từ theo quy định và đăng ký nộp thuế theo phương pháp kê khai.
• Doanh nghiệp có dự án đầu tư (bao gồm cả dự án đầu tư mới và dự án đầu tư mở rộng) đáp ứng các điều kiện về lĩnh vực ưu đãi hoặc địa bàn ưu đãi đầu tư theo quy định của Luật Thuế TNDN sẽ được hưởng mức thuế suất ưu đãi, thời gian miễn thuế và giảm thuế tương ứng.
• Trong cùng một kỳ tính thuế, nếu doanh nghiệp có phát sinh hoạt động sản xuất kinh doanh được hưởng nhiều mức ưu đãi thuế khác nhau đối với cùng một khoản thu nhập thì doanh nghiệp được lựa chọn áp dụng mức ưu đãi thuế có lợi nhất.

Chính sách ưu đãi đối với dự án đầu tư mở rộng

• Doanh nghiệp đang hoạt động có dự án đầu tư phát triển dự án đang hoạt động nhằm mở rộng quy mô, nâng cao công suất, đổi mới công nghệ sản xuất nếu đáp ứng các tiêu chí theo quy định của pháp luật thuế TNDN thì được lựa chọn hưởng ưu đãi.
• Doanh nghiệp được lựa chọn hưởng ưu đãi thuế TNDN theo dự án đang hoạt động cho thời gian còn lại (nếu có) hoặc được áp dụng thời gian miễn thuế, giảm thuế đối với phần thu nhập tăng thêm do đầu tư mở rộng mang lại.
• Thời gian miễn thuế, giảm thuế đối với thu nhập tăng thêm từ đầu tư mở rộng bằng với thời gian miễn thuế, giảm thuế áp dụng đối với dự án đầu tư mới trên cùng địa bàn hoặc lĩnh vực ưu đãi thuế TNDN.

Quản lý và thực hiện thủ tục ưu đãi thuế

• Doanh nghiệp có trách nhiệm tự xác định các điều kiện ưu đãi thuế, mức thuế suất ưu đãi, thời gian miễn thuế, giảm thuế và số lỗ được chuyển trừ vào thu nhập chịu thuế để tự kê khai và tự quyết toán thuế với cơ quan thuế.
• Cơ quan thuế có trách nhiệm thanh tra, kiểm tra việc thực hiện điều kiện áp dụng ưu đãi thuế của doanh nghiệp. Trường hợp phát hiện doanh nghiệp kê khai không đúng điều kiện hoặc không đủ điều kiện hưởng ưu đãi, cơ quan thuế sẽ thực hiện truy thu thuế và xử phạt vi phạm hành chính về thuế theo quy định hiện hành.

Công văn 5669/TCT-CS năm 2014 là cơ sở pháp lý quan trọng giúp doanh nghiệp nắm vững quyền lợi về ưu đãi thuế, đồng thời hỗ trợ cơ quan thuế địa phương thực hiện quản lý thuế một cách minh bạch, thống nhất và đúng pháp luật.