Công văn 5902/TCT-DNL do Tổng cục Thuế ban hành năm 2014 hướng dẫn về việc tính tiền chậm nộp thuế đối với Dự án cải cách Quản lý tài chính công (PFMRP). Đây là văn bản quan trọng nhằm giải quyết các vướng mắc về nghĩa vụ thuế phát sinh từ các dự án sử dụng nguồn vốn hỗ trợ phát triển chính thức (ODA) và vốn đối ứng từ ngân sách nhà nước.

Phạm vi và đối tượng áp dụng

Văn bản áp dụng đối với Ban Quản lý Dự án cải cách Quản lý tài chính công, các nhà thầu thực hiện dự án, cơ quan thuế các cấp và các tổ chức, cá nhân có liên quan trực tiếp đến việc quản lý, quyết toán nguồn vốn và thực hiện nghĩa vụ thuế của dự án.

Nội dung hướng dẫn cốt lõi về tính tiền chậm nộp thuế

• Nguyên tắc không tính tiền chậm nộp do chậm thanh toán vốn ngân sách: Đối với các khoản nợ thuế phát sinh từ việc thực hiện các gói thầu thuộc Dự án cải cách Quản lý tài chính công, nếu nguyên nhân chậm nộp thuế xuất phát từ việc ngân sách nhà nước (bao gồm cả nguồn vốn ODA) chưa kịp thời thanh toán cho nhà thầu hoặc ban quản lý dự án, thì sẽ được xem xét không tính tiền chậm nộp thuế trong khoảng thời gian bị chậm thanh toán.
• Giới hạn số tiền thuế không tính chậm nộp: Số tiền thuế nợ được tạm thời không tính tiền chậm nộp phải tương ứng và không vượt quá số tiền mà ngân sách nhà nước hoặc nguồn vốn ODA chưa thanh toán cho dự án hoặc nhà thầu tại thời điểm phát sinh nghĩa vụ thuế.
• Yêu cầu về hồ sơ chứng minh: Để được áp dụng chính sách không tính tiền chậm nộp, đơn vị nộp thuế phải cung cấp đầy đủ hồ sơ pháp lý bao gồm: văn bản đề nghị của người nộp thuế; hợp đồng ký kết thực hiện dự án; văn bản xác nhận của cơ quan có thẩm quyền hoặc chủ đầu tư về việc chưa được thanh toán nguồn vốn ngân sách; và các chứng từ liên quan đến khối lượng công việc đã hoàn thành nhưng chưa được giải ngân.
• Trách nhiệm của người nộp thuế: Người nộp thuế có nghĩa vụ kê khai trung thực, chính xác số liệu nợ thuế và số tiền chưa được thanh toán. Ngay sau khi nhận được nguồn vốn thanh toán từ ngân sách nhà nước hoặc nguồn ODA, người nộp thuế phải thực hiện nộp ngay số tiền thuế còn nợ vào ngân sách nhà nước theo quy định.
• Trách nhiệm của cơ quan thuế quản lý: Cơ quan thuế có trách nhiệm tiếp nhận, kiểm tra, đối chiếu hồ sơ do người nộp thuế cung cấp. Trên cơ sở đó, thực hiện giám sát chặt chẽ tiến độ giải ngân của dự án để đôn đốc thu hồi nợ thuế kịp thời ngay khi nguồn vốn được khơi thông, đồng thời xử lý nghiêm các trường hợp lợi dụng chính sách để trì hoãn nghĩa vụ thuế.

Hiệu lực và hướng dẫn thi hành

Công văn 5902/TCT-DNL có hiệu lực thi hành kể từ ngày ban hành. Các hướng dẫn tại công văn này được áp dụng thống nhất cho các trường hợp vướng mắc tương tự của Dự án cải cách Quản lý tài chính công nhằm tháo gỡ khó khăn tài chính cho các đơn vị triển khai dự án trọng điểm của ngành tài chính.