Công văn 7078/TCHQ-TXNK do Tổng cục Hải quan ban hành năm 2020 là văn bản hướng dẫn nghiệp vụ quan trọng nhằm tháo gỡ các vướng mắc liên quan đến thủ tục hoàn thuế nhập khẩu đối với hàng hóa nhập khẩu để sản xuất xuất khẩu. Văn bản này đưa ra các chỉ đạo cụ thể giúp cơ quan hải quan địa phương và doanh nghiệp thống nhất thực hiện đúng quy định của Luật Thuế xuất khẩu, thuế nhập khẩu và Nghị định số 134/2016/NĐ-CP.

- Đối tượng và điều kiện áp dụng hoàn thuế nhập khẩu

• Nguyên liệu, vật tư, linh kiện nhập khẩu để sản xuất hàng hóa xuất khẩu được hoàn thuế nhập khẩu khi sản phẩm thực tế đã được xuất khẩu ra nước ngoài hoặc xuất khẩu vào khu phi thuế quan.
• Doanh nghiệp phải đáp ứng điều kiện có cơ sở sản xuất hàng hóa xuất khẩu trên lãnh thổ Việt Nam, có quyền sở hữu hoặc quyền sử dụng hợp pháp đối với máy móc, thiết bị tại cơ sở sản xuất phù hợp với nguyên liệu nhập khẩu.
• Quy trình sản xuất phải được thực hiện trên thực tế và doanh nghiệp phải thực hiện báo cáo quyết toán tình hình sử dụng nguyên liệu, vật tư nhập khẩu với cơ quan hải quan.

- Hướng dẫn hoàn thuế đối với trường hợp xuất khẩu tại chỗ

• Sản phẩm sản xuất từ nguyên liệu nhập khẩu được xuất khẩu tại chỗ theo chỉ định của thương nhân nước ngoài chỉ được xem xét hoàn thuế khi người xuất khẩu tại chỗ đã hoàn thành thủ tục hải quan và sản phẩm đã được người nhập khẩu tại chỗ thông quan.
• Doanh nghiệp cần xuất trình đầy đủ tờ khai hải quan xuất khẩu - nhập khẩu tại chỗ đã được thông quan, hợp đồng mua bán có điều khoản chỉ định giao hàng tại Việt Nam và chứng từ thanh toán qua ngân hàng hợp lệ.
• Cơ quan hải quan thực hiện kiểm tra chéo thông tin giữa tờ khai xuất khẩu của doanh nghiệp sản xuất và tờ khai nhập khẩu đối ứng của đối tác nội địa để đảm bảo tính đồng bộ và chính xác của dữ liệu.

- Thành phần hồ sơ và thủ tục hoàn thuế

• Hồ sơ hoàn thuế bao gồm: Công văn yêu cầu hoàn thuế theo mẫu quy định; Tờ khai hải quan nhập khẩu nguyên liệu và tờ khai hải quan xuất khẩu sản phẩm; Hợp đồng xuất khẩu, nhập khẩu; Chứng từ thanh toán qua ngân hàng; Báo cáo tính toán định mức thực tế sử dụng.
• Doanh nghiệp nộp hồ sơ hoàn thuế đến cơ quan hải quan nơi phát sinh tờ khai nhập khẩu nguyên liệu, vật tư để được giải quyết theo thẩm quyền.
• Thời hạn giải quyết hồ sơ hoàn thuế được thực hiện nghiêm ngặt theo quy định của Luật Quản lý thuế nhằm bảo đảm quyền lợi tài chính nhanh chóng cho doanh nghiệp.

- Công tác kiểm tra, giám sát và chống gian lận thuế

• Tổng cục Hải quan yêu cầu các cục hải quan tỉnh, thành phố tăng cường công tác kiểm tra sau thông quan đối với các hồ sơ hoàn thuế nhập khẩu cho hàng sản xuất xuất khẩu.
• Tập trung kiểm tra tính chính xác của định mức tiêu hao nguyên liệu do doanh nghiệp tự xây dựng và khai báo so với thực tế năng lực sản xuất của nhà máy.
• Kiên quyết xử lý nghiêm các hành vi khai khống, sử dụng chứng từ giả mạo hoặc không lưu trữ đầy đủ sổ sách kế toán nhằm mục đích trục lợi tiền hoàn thuế từ ngân sách nhà nước.