Để phục vụ yêu cầu quản lý ngân sách nhà nước (NSNN), ngày 02/6/2008, Bộ trưởng Bộ Tài chính ban hành Quyết định số 33/2008/QĐ-BTC quy định về Mục Lục NSNN. Ngày 09/9/2008, Bộ Tài chính có công văn số 10532/BTC-NSNN hướng dẫn thực hiện một số nội dung của Mục lục NSNN. Theo đề nghị của một số Bộ, cơ quan trung ương, địa phương; Bộ Tài chính hướng dẫn hạch toán Mục lục NSNN đối với một số khoản chi NSNN có tính đặc thù, như sau:

1. Về hạch toán các khoản chi sự nghiệp và các khoản chi khác từ kinh phí thường xuyên nhưng có tính chất đầu tư:

Khi chi các khoản chi sự nghiệp và các khoản chi khác từ kinh phí thường xuyên nhưng có tính chất đầu tư, kế toán căn cứ chứng từ hợp pháp theo quy định để hạch toán vào các mục chi tương ứng từ nguồn vốn thường xuyên, như: Mục 6900, Mục 7000, Mục 7350, Mục 8150…, không hạch toán vào Mục 9100 và các Mục chi xây dựng cơ bản (từ Mục 9200 đến Mục 9400).

2. Về hạch toán khoản chi đầu tư xây dựng cơ bản được bố trí từ nguồn vốn thường xuyên theo quy định của cấp có thẩm quyền:

Căn cứ cơ chế quản lý tài chính - ngân sách được cơ quan có thẩm quyền quyết định cho phép dành một phần nguồn ngân sách chi thường xuyên để bố trí chi đầu tư xây dựng cơ bản (đối với các đơn vị thuộc Bộ Quốc phòng, Bộ Công an…); căn cứ quyết định phân bổ, giao dự toán vốn đầu tư (quyết định phân bổ, giao dự toán phải ghi rõ phần chi đầu tư xây dựng cơ bản được bố trí từ nguồn vốn thường xuyên của NSNN) cho từng dự án, công trình của cơ quan có thẩm quyền, kế toán hạch toán theo mã nguồn 29 quy định tại Thông tư số 212/2009/TT-BTC ngày 06/11/2009 của Bộ Tài chính. Khi chi ngân sách, căn cứ nội dung thực chi ngân sách để hạch toán vào các mục tương ứng từ Mục 9200 đến Mục 9400. Khi tổng hợp báo cáo theo nội dung, chỉ tiêu giao dự toán, căn cứ mã nguồn 29 để tổng hợp vào chi thường xuyên theo đúng nội dung dự toán được cấp có thẩm quyền giao.

3. Về hạch toán khoản mua, đầu tư tài sản vô hình và khoản mua sắm tài sản dùng cho công tác chuyên môn từ nguồn kinh phí thường xuyên:

- Khi chi ngân sách để mua, đầu tư tài sản vô hình - hạch toán Mục 9000;

- Khi chi ngân sách để mua sắm tài sản dùng cho công tác chuyên môn - hạch toán Mục 9050.

Căn cứ dự toán được giao hai khoản chi nêu trên, kế toán hạch toán mã nguồn 29 (ban hành kèm theo Thông tư số 212/2009/TT-BTC ngày 06/11/2009 của Bộ Tài chính). Hai khoản chi nêu trên hình thành tài sản của đơn vị từ nguồn chi thường xuyên nên khi tổng hợp báo cáo theo nội dung, chỉ tiêu giao dự toán, căn cứ mã nguồn 29 để tổng hợp vào chi thường xuyên theo đúng nội dung dự toán được cấp có thẩm quyền giao.

(Đối với khoản chi mua sắm tài sản, thiết bị, công nghệ từ nguồn vốn đầu tư - hạch toán vào Tiểu mục 9351. Khoản chi này được tổng hợp, báo cáo vào nhiệm vụ chi đầu tư xây dựng cơ bản theo đúng nội dung, chỉ tiêu dự toán được cấp có thẩm quyền giao).

4. Về hạch toán khoản tạm thu, tạm chi chưa đưa vào cân đối ngân sách nhà nước:

a) Khi có các khoản tạm thu (như ngân sách cấp trên tạm ứng cho ngân sách cấp dưới), hoặc vay chưa đưa vào cân đối ngân sách (như vay quỹ dự trữ tài chính), thì hạch toán vào các Mục tương ứng từ Mục 0001 đến Mục 0049.