Công văn 79555/CT-TTHT do Cục Thuế thành phố Hà Nội ban hành năm 2018 là văn bản hướng dẫn quan trọng về chính sách thuế nhà thầu nước ngoài đối với các doanh nghiệp Việt Nam phát sinh hoạt động thuê chuyên gia nước ngoài để thực hiện tư vấn phần mềm. Dưới đây là nội dung tóm tắt chi tiết và chuyên sâu về các quy định pháp lý cốt lõi được đề cập trong văn bản này.

- Đối tượng áp dụng và phạm vi điều chỉnh của thuế nhà thầu

• Văn bản hướng dẫn áp dụng đối với tổ chức nước ngoài (không có cơ sở thường trú tại Việt Nam) hoặc cá nhân nước ngoài (không là đối tượng cư trú tại Việt Nam) thực hiện cung cấp dịch vụ tư vấn phần mềm trên cơ sở hợp đồng ký kết với doanh nghiệp Việt Nam.
• Thu nhập phát sinh của chuyên gia nước ngoài từ hoạt động tư vấn phần mềm cho tổ chức tại Việt Nam thuộc đối tượng chịu thuế nhà thầu nước ngoài (bao gồm thuế Giá trị gia tăng và thuế Thu nhập doanh nghiệp) theo quy định tại Thông tư số 103/2014/TT-BTC.

- Quy định về Thuế Giá trị gia tăng (GTGT) đối với dịch vụ tư vấn phần mềm

• Căn cứ theo quy định tại Thông tư số 219/2013/TT-BTC của Bộ Tài chính, các dịch vụ phần mềm thuộc đối tượng không chịu thuế GTGT.
• Trường hợp dịch vụ của chuyên gia nước ngoài được xác định chính xác là dịch vụ phần mềm theo quy định của pháp luật về công nghệ thông tin (bao gồm thiết kế, cài đặt, kiểm thử, bảo trì phần mềm) thì hoạt động này thuộc đối tượng không chịu thuế GTGT.
• Trường hợp hợp đồng thuê chuyên gia thực hiện các hoạt động tư vấn công nghệ thông tin chung, tư vấn quản lý hoặc các dịch vụ tư vấn khác không thuộc danh mục dịch vụ phần mềm được miễn thuế, dịch vụ này sẽ phải chịu thuế GTGT với tỷ lệ % tính trên doanh thu tính thuế là 5%.

- Quy định về Thuế Thu nhập doanh nghiệp (TNDN) đối với nhà thầu nước ngoài

• Thu nhập của nhà thầu nước ngoài từ hoạt động cung cấp dịch vụ tư vấn phần mềm cho doanh nghiệp Việt Nam là thu nhập chịu thuế TNDN tại Việt Nam.
• Tỷ lệ (%) thuế TNDN tính trên doanh thu tính thuế đối với dịch vụ tư vấn, dịch vụ phần mềm được áp dụng là 5% theo quy định tại Khoản 2 Điều 13 Thông tư số 103/2014/TT-BTC.

- Trách nhiệm kê khai, khấu trừ và nộp thuế của bên Việt Nam

• Doanh nghiệp Việt Nam (bên thuê dịch vụ) có trách nhiệm khấu trừ số thuế GTGT (nếu có) và thuế TNDN từ khoản thanh toán cho nhà thầu nước ngoài trước khi thực hiện chuyển tiền ra nước ngoài.
• Thời hạn khai thuế và nộp thuế thay cho nhà thầu nước ngoài thực hiện theo quy định của pháp luật về quản lý thuế hiện hành (theo từng lần phát sinh thanh toán hoặc khai theo tháng nếu đáp ứng điều kiện).
• Doanh nghiệp Việt Nam phải thực hiện đăng ký thuế, kê khai mẫu tờ khai thuế nhà thầu và nộp tiền thuế vào ngân sách nhà nước đầy đủ để tránh các rủi ro pháp lý về phạt chậm nộp hoặc truy thu thuế.

Lưu ý: Doanh nghiệp cần rà soát kỹ lưỡng các điều khoản trong hợp đồng dịch vụ với chuyên gia nước ngoài để xác định rõ bản chất dịch vụ là dịch vụ phần mềm hay dịch vụ tư vấn thông thường, từ đó áp dụng đúng chính sách thuế GTGT tương ứng nhằm tối ưu hóa chi phí và đảm bảo tuân thủ pháp luật.