Công văn số 1900/TCT-CS do Tổng cục Thuế ban hành là văn bản hướng dẫn quan trọng về việc xác định thuế suất thuế giá trị gia tăng (GTGT) đối với hoạt động gia công, sơ chế hàng thủy sản. Văn bản này giúp tháo gỡ các vướng mắc của doanh nghiệp và cơ quan thuế địa phương trong việc phân biệt giữa dịch vụ sơ chế bảo quản và dịch vụ gia công chế biến, từ đó áp dụng đúng mức thuế suất theo quy định pháp luật hiện hành.

- Cơ sở pháp lý áp dụng thuế giá trị gia tăng

Tổng cục Thuế căn cứ vào các văn bản quy phạm pháp luật về thuế GTGT để đưa ra hướng dẫn thống nhất, bao gồm:

• Luật Thuế giá trị gia tăng và các Luật sửa đổi, bổ sung liên quan.
• Nghị định số 209/2013/NĐ-CP của Chính phủ quy định chi tiết và hướng dẫn thi hành một số điều của Luật Thuế giá trị gia tăng.
• Thông tư số 219/2013/TT-BTC của Bộ Tài chính hướng dẫn thi hành Luật Thuế giá trị gia tăng (đã được sửa đổi, bổ sung bởi Thông tư số 26/2015/TT-BTC).

- Quy định về thuế suất đối với dịch vụ sơ chế, bảo quản thủy sản

Theo hướng dẫn tại Thông tư số 219/2013/TT-BTC, dịch vụ sơ chế, bảo quản sản phẩm nông nghiệp (bao gồm cả thủy sản) được áp dụng mức thuế suất ưu đãi. Cụ thể:

• Các hoạt động được coi là sơ chế, bảo quản bao gồm: làm sạch, phơi, sấy, bóc vỏ, phân loại, cắt, đông lạnh, ướp muối, bảo quản bằng hóa chất và các hình thức bảo quản thông thường khác nhằm giữ cho sản phẩm tươi sống, không bị hư hỏng.
• Khi doanh nghiệp thực hiện các dịch vụ sơ chế, bảo quản này cho khách hàng (nhận gia công sơ chế), hoạt động này được xác định là dịch vụ sơ chế, bảo quản sản phẩm nông nghiệp và áp dụng mức thuế suất thuế GTGT là 5%.

- Quy định về thuế suất đối với dịch vụ gia công, chế biến sâu

Đối với các hoạt động gia công có tính chất chế biến sâu, làm thay đổi đặc tính vật lý, hóa học hoặc biến đổi sản phẩm thủy sản thành sản phẩm khác, mức thuế suất được áp dụng như sau:

• Nếu hoạt động gia công bao gồm việc tẩm ướp gia vị, nấu chín, đóng hộp hoặc kết hợp với các nguyên liệu khác để tạo thành sản phẩm thực phẩm chế biến sẵn, hoạt động này không còn được coi là dịch vụ sơ chế thông thường.
• Dịch vụ gia công, chế biến các sản phẩm thủy sản đã qua chế biến sâu này phải áp dụng mức thuế suất thuế GTGT thông thường là 10%.

- Phân biệt thuế GTGT tại khâu thương mại và khâu dịch vụ gia công

Công văn cũng lưu ý việc phân biệt giữa thuế suất áp dụng cho dịch vụ gia công và thuế suất áp dụng khi bán sản phẩm thủy sản ở khâu kinh doanh thương mại:

• Đối với khâu kinh doanh thương mại: Sản phẩm thủy sản mới qua sơ chế thông thường do doanh nghiệp, hợp tác xã bán cho doanh nghiệp, hợp tác xã khác ở khâu kinh doanh thương mại thì thuộc đối tượng không phải kê khai, tính nộp thuế GTGT. Nếu bán cho hộ, cá nhân kinh doanh hoặc các tổ chức, cá nhân khác thì áp dụng thuế suất 5%.
• Đối với khâu dịch vụ (gia công, sơ chế thuê): Thuế suất áp dụng là thuế suất của dịch vụ thực hiện (5% đối với dịch vụ sơ chế, bảo quản; 10% đối với dịch vụ gia công chế biến sâu), không áp dụng quy định miễn kê khai, tính nộp thuế như đối với hoạt động mua bán hàng hóa.

- Hướng dẫn tổ chức thực hiện cho người nộp thuế

Để đảm bảo thực hiện đúng quy định pháp luật và tránh rủi ro bị truy thu thuế, Tổng cục Thuế yêu cầu:

• Các Cục Thuế địa phương căn cứ vào hồ sơ thực tế, hợp đồng gia công, quy trình công nghệ thực tế của từng doanh nghiệp để xác định chính xác bản chất của hoạt động dịch vụ là sơ chế bảo quản hay gia công chế biến sâu.
• Doanh nghiệp có trách nhiệm phân loại rõ ràng doanh thu từ hoạt động dịch vụ sơ chế (thuế suất 5%) và dịch vụ gia công chế biến (thuế suất 10%) trên hóa đơn GTGT và tờ khai thuế. Trường hợp không tách riêng được, doanh nghiệp phải áp dụng mức thuế suất cao nhất là 10%.