Giới thiệu về Công văn số 2939/TCT-CS

Công văn số 2939/TCT-CS do Tổng cục Thuế ban hành là văn bản hướng dẫn quan trọng về chính sách và thủ tục hoàn thuế giá trị gia tăng (GTGT) đối với các dự án sử dụng nguồn vốn hỗ trợ phát triển chính thức (ODA). Văn bản này tháo gỡ các vướng mắc thực tế cho các chủ đầu tư, nhà thầu chính và cơ quan thuế địa phương trong quá trình thực hiện hoàn thuế, đảm bảo tuân thủ đúng quy định của pháp luật quản lý thuế và các điều ước quốc tế mà Việt Nam là thành viên.

Đối tượng được áp dụng hoàn thuế GTGT đối với dự án ODA

Theo hướng dẫn, các đối tượng sau đây thuộc diện được xem xét hoàn thuế GTGT đầu vào đối với hàng hóa, dịch vụ mua trong nước phục vụ cho dự án ODA:

• Chủ chương trình, dự án ODA không hoàn lại: Chủ đầu tư hoặc đơn vị quản lý dự án được giao nhiệm vụ quản lý, sử dụng nguồn vốn ODA không hoàn lại để mua sắm hàng hóa, dịch vụ phục vụ trực tiếp cho hoạt động của dự án.
• Nhà thầu chính nước ngoài: Nhà thầu trực tiếp ký hợp đồng với nhà tài trợ nước ngoài hoặc chủ đầu tư dự án ODA không hoàn lại để thực hiện các gói thầu của dự án.
• Văn phòng đại diện nhà tài trợ dự án ODA: Các tổ chức, văn phòng đại diện được thành lập hợp pháp tại Việt Nam thực hiện chức năng quản lý, giám sát dự án theo thỏa thuận ký kết.

Điều kiện để được hoàn thuế GTGT đối với dự án ODA

Để được cơ quan thuế chấp thuận hoàn thuế GTGT, các đơn vị phải đáp ứng đầy đủ các điều kiện nghiêm ngặt sau:

• Tính hợp pháp của dự án: Dự án ODA phải được cơ quan có thẩm quyền của Việt Nam phê duyệt danh mục hoặc quyết định đầu tư theo đúng quy định pháp luật về quản lý và sử dụng vốn ODA.
• Chứng từ thanh toán qua ngân hàng: Hàng hóa, dịch vụ mua vào phục vụ dự án phải có hóa đơn GTGT hợp pháp và chứng từ thanh toán không dùng tiền mặt (qua ngân hàng) đối với các hóa đơn có giá trị từ 20 triệu đồng trở lên.
• Đăng ký và kê khai thuế: Chủ dự án hoặc nhà thầu chính phải thực hiện đăng ký thuế, được cấp mã số thuế và thực hiện kê khai thuế GTGT theo phương pháp khấu trừ theo đúng quy định.

Hồ sơ và thủ tục đề nghị hoàn thuế GTGT

Công văn hướng dẫn chi tiết về thành phần hồ sơ hoàn thuế nhằm tạo điều kiện thuận lợi cho người nộp thuế, bao gồm:

• Giấy đề nghị hoàn trả khoản thu ngân sách nhà nước: Sử dụng mẫu biểu quy định hiện hành (Mẫu số 01/HT ban hành kèm theo Thông tư số 80/2021/TT-BTC).
• Tài liệu chứng minh nguồn vốn ODA: Bản sao quyết định phê duyệt dự án ODA, văn kiện dự án hoặc hiệp định, thỏa thuận ký kết giữa Chính phủ Việt Nam và nhà tài trợ nước ngoài.
• Bảng kê hóa đơn, chứng từ: Danh mục chi tiết các hóa đơn GTGT mua vào, chứng từ thanh toán qua ngân hàng liên quan đến hàng hóa, dịch vụ đề nghị hoàn thuế.
• Văn bản ủy quyền (nếu có): Trường hợp chủ dự án ủy quyền cho văn phòng quản lý dự án hoặc đơn vị khác thực hiện thủ tục hoàn thuế.

Nguyên tắc xử lý và trách nhiệm của cơ quan thuế

Tổng cục Thuế yêu cầu các Cục Thuế địa phương thực hiện công tác hoàn thuế một cách minh bạch, nhanh chóng nhưng phải đảm bảo chặt chẽ:

• Phân loại hồ sơ hoàn thuế: Thực hiện phân loại hồ sơ thuộc diện "Hoàn thuế trước, kiểm tra sau" hoặc "Kiểm tra trước, hoàn thuế sau" theo đúng quy định của Luật Quản lý thuế.
• Thanh tra, kiểm tra sau hoàn thuế: Tăng cường công tác hậu kiểm đối với các hồ sơ đã được hoàn thuế trước nhằm phát hiện và xử lý kịp thời các trường hợp gian lận, sử dụng hóa đơn bất hợp pháp hoặc khai khống số thuế được hoàn.
• Phối hợp liên ngành: Trong trường hợp cần thiết, cơ quan thuế chủ động phối hợp với Bộ Tài chính, Bộ Kế hoạch và Đầu tư hoặc các cơ quan chủ quản dự án để xác minh nguồn vốn và tính hợp lệ của dự án ODA.