Công văn số 3581/TCT-CS do Tổng cục Thuế ban hành nhằm hướng dẫn chi tiết về công tác hoàn thuế giá trị gia tăng (GTGT) và khai thuế GTGT đối với các dự án đầu tư, chi nhánh và đơn vị phụ thuộc của doanh nghiệp, giải quyết các vướng mắc thực tế trong quá trình thực thi pháp luật thuế.

Phạm vi và đối tượng áp dụng

Văn bản này áp dụng đối với các Cục Thuế tỉnh, thành phố trực thuộc Trung ương trong việc thống nhất quản lý, hướng dẫn người nộp thuế; đồng thời áp dụng trực tiếp cho các doanh nghiệp, tổ chức kinh tế có phát sinh dự án đầu tư mới hoặc có hoạt động sản xuất kinh doanh thông qua các chi nhánh, đơn vị phụ thuộc trên phạm vi cả nước.

Quy định về khai thuế GTGT đối với dự án đầu tư

• Doanh nghiệp đang hoạt động sản xuất kinh doanh nộp thuế GTGT theo phương pháp khấu trừ khi có dự án đầu tư mới (bao gồm cả dự án đầu tư cùng tỉnh hoặc khác tỉnh, thành phố nơi đóng trụ sở chính) phải thực hiện kê khai thuế GTGT riêng cho dự án đầu tư.
• Việc kê khai thuế GTGT của dự án đầu tư được thực hiện theo Mẫu số 02/GTGT ban hành kèm theo Thông tư số 80/2021/TT-BTC của Bộ Tài chính.
• Số thuế GTGT đầu vào của dự án đầu tư phải được bù trừ với số thuế GTGT phải nộp của hoạt động sản xuất kinh doanh đang thực hiện tại trụ sở chính trước khi xác định số thuế được hoàn.

Điều kiện hoàn thuế GTGT đối với dự án đầu tư mới

• Dự án đầu tư phải được cơ quan nhà nước có thẩm quyền cấp Giấy chứng nhận đăng ký đầu tư, Giấy chứng nhận đăng ký doanh nghiệp hoặc các giấy tờ pháp lý tương đương theo quy định của pháp luật về đầu tư.
• Dự án đầu tư phải là dự án đầu tư mới đang trong giai đoạn đầu tư, chưa đi vào hoạt động sản xuất kinh doanh và chưa đăng ký kinh doanh, đăng ký thuế.
• Số thuế GTGT đầu vào lũy kế của hàng hóa, dịch vụ mua vào sử dụng cho dự án đầu tư chưa được khấu trừ hết từ 300 triệu đồng trở lên thì được xem xét hoàn thuế GTGT theo quy định.
• Doanh nghiệp phải thực hiện đầy đủ chế độ kế toán, hóa đơn, chứng từ và thực hiện thanh toán không dùng tiền mặt đối với các giao dịch mua vào có giá trị từ 20 triệu đồng trở lên.

Khai thuế GTGT đối với chi nhánh và đơn vị phụ thuộc

• Trường hợp chi nhánh, đơn vị phụ thuộc trực tiếp bán hàng, phát sinh doanh thu và sử dụng hóa đơn riêng thì phải thực hiện đăng ký thuế, khai thuế và nộp thuế GTGT trực tiếp với cơ quan thuế quản lý trực tiếp của chi nhánh.
• Trường hợp đơn vị phụ thuộc không trực tiếp bán hàng, không phát sinh doanh thu thì thực hiện khai thuế tập trung tại trụ sở chính của doanh nghiệp theo quy định của Luật Quản lý thuế và Nghị định số 126/2020/NĐ-CP.
• Việc phân bổ số thuế GTGT phải nộp đối với các đơn vị phụ thuộc, địa điểm kinh doanh khác tỉnh với nơi đóng trụ sở chính phải tuân thủ đúng tỷ lệ và phương pháp phân bổ quy định tại Thông tư số 80/2021/TT-BTC.

Hiệu lực thi hành và tổ chức thực hiện

Công văn số 3581/TCT-CS có hiệu lực áp dụng kể từ ngày ban hành. Các nội dung hướng dẫn tại công văn này được thực hiện nhất quán với các quy định của Luật Thuế giá trị gia tăng, Luật Quản lý thuế và các văn bản hướng dẫn thi hành. Trong quá trình thực hiện, nếu có vướng mắc phát sinh, các Cục Thuế và người nộp thuế cần kịp thời báo cáo về Tổng cục Thuế để được xem xét, giải quyết.