Công văn số 3755/TCT-CS do Tổng cục Thuế ban hành hướng dẫn chi tiết về việc lập hóa đơn, khấu trừ và hoàn thuế giá trị gia tăng (GTGT) đối với hàng hóa xuất nhập khẩu, nhằm tháo gỡ các vướng mắc phát sinh và thống nhất quy trình thực hiện trên toàn quốc.

Phạm vi và đối tượng áp dụng

Văn bản này áp dụng đối với các tổ chức, doanh nghiệp có hoạt động sản xuất, kinh doanh, xuất khẩu và nhập khẩu hàng hóa, dịch vụ; cơ quan thuế các cấp thực hiện công tác quản lý thuế, thanh tra, kiểm tra và giải quyết hồ sơ hoàn thuế GTGT cho người nộp thuế.

- Quy định về thời điểm và loại hóa đơn đối với hàng hóa xuất khẩu

• Thời điểm lập hóa đơn điện tử đối với hàng hóa xuất khẩu được xác định sau khi cơ quan hải quan đã hoàn thành thủ tục thông quan đối với tờ khai hải quan xuất khẩu.
• Cơ sở kinh doanh phải sử dụng hóa đơn giá trị gia tăng điện tử hoặc hóa đơn bán hàng điện tử khi xuất khẩu hàng hóa, dịch vụ ra nước ngoài, vào khu phi thuế quan theo đúng quy định tại Nghị định số 123/2020/NĐ-CP.
• Việc lập hóa đơn phải đảm bảo tính chính xác về mặt thời gian và số liệu để làm cơ sở pháp lý cho việc kê khai, tính thuế và hoàn thuế GTGT đầu vào.

- Điều kiện khấu trừ và hoàn thuế GTGT đối với hàng hóa xuất khẩu

• Doanh nghiệp muốn được khấu trừ và hoàn thuế GTGT đầu vào đối với hàng hóa xuất khẩu phải có đầy đủ hồ sơ, chứng từ theo quy định, bao gồm: Hợp đồng xuất khẩu, tờ khai hải quan đã thông quan, hóa đơn thương mại hoặc hóa đơn GTGT hợp lệ.
• Chứng từ thanh toán qua ngân hàng phải đảm bảo là chứng từ thanh toán không dùng tiền mặt, trùng khớp về thông tin đơn vị nhập khẩu, số tiền thanh toán và tài khoản giao dịch theo đúng quy định của pháp luật về thuế.
• Đối với các trường hợp phía nước ngoài thanh toán chậm hoặc có sự thay đổi về phương thức thanh toán, doanh nghiệp phải xuất trình được các văn bản giải trình, phụ lục hợp đồng liên quan để cơ quan thuế đối chiếu, kiểm tra.

- Xử lý các trường hợp sai sót về hóa đơn và thời điểm lập hóa đơn

• Trường hợp doanh nghiệp lập hóa đơn không đúng thời điểm (lập trước hoặc sau thời điểm thông quan hải quan), cơ quan thuế sẽ tiến hành kiểm tra, xác định nguyên nhân cụ thể để xử phạt vi phạm hành chính về hóa đơn theo quy định hiện hành.
• Việc lập hóa đơn sai thời điểm có thể ảnh hưởng trực tiếp đến việc xác định kỳ tính thuế và xét duyệt hoàn thuế GTGT. Doanh nghiệp có trách nhiệm thực hiện điều chỉnh, bổ sung thông tin theo hướng dẫn của cơ quan thuế quản lý trực tiếp.
• Các hồ sơ hoàn thuế có dấu hiệu rủi ro cao hoặc có nghi ngờ về tính trung thực của giao dịch xuất nhập khẩu sẽ được chuyển sang diện kiểm tra trước, hoàn thuế sau để bảo đảm tính nghiêm minh của pháp luật.

Hiệu lực thi hành và tổ chức thực hiện

Công văn số 3755/TCT-CS có hiệu lực hướng dẫn kể từ ngày ban hành. Tổng cục Thuế yêu cầu Cục Thuế các tỉnh, thành phố trực thuộc Trung ương phổ biến rộng rãi và hướng dẫn các doanh nghiệp trên địa bàn thực hiện nghiêm túc, đúng quy định nhằm tạo điều kiện thuận lợi cho hoạt động xuất nhập khẩu phát triển lành mạnh.