Công văn số 46/TCT-CS do Tổng cục Thuế ban hành hướng dẫn về việc hoàn thuế giá trị gia tăng (GTGT) đầu vào cho các dự án sử dụng nguồn vốn hỗ trợ phát triển chính thức (ODA). Đây là văn bản hướng dẫn nghiệp vụ quan trọng nhằm tháo gỡ các vướng mắc pháp lý, thống nhất quy trình thực hiện hoàn thuế GTGT cho các chủ đầu tư và nhà thầu chính thực hiện dự án ODA tại Việt Nam theo đúng quy định pháp luật hiện hành.

Phạm vi và đối tượng áp dụng của văn bản

Văn bản hướng dẫn áp dụng đối với các đối tượng và phạm vi cụ thể sau:

• Đối tượng áp dụng: Các chủ chương trình, dự án ODA, các nhà thầu chính nước ngoài trực tiếp thực hiện dự án ODA, văn phòng đại diện nhà tài trợ dự án ODA, cùng các cục thuế địa phương chịu trách nhiệm tiếp nhận và xử lý hồ sơ hoàn thuế.
• Phạm vi điều chỉnh: Quy trình, điều kiện và hồ sơ đề nghị hoàn thuế GTGT đầu vào đối với các dự án ODA không hoàn lại và dự án ODA vay ưu đãi có cơ chế tài chính được ngân sách nhà nước cấp phát toàn bộ.

Các nội dung chính sách cốt lõi về hoàn thuế GTGT cho dự án ODA

Tổng cục Thuế đưa ra các hướng dẫn chi tiết về điều kiện, hồ sơ và trách nhiệm của các bên liên quan trong quá trình hoàn thuế GTGT đầu vào như sau:

1. Xác định đối tượng được hoàn thuế GTGT

• Chủ dự án ODA không hoàn lại hoặc nhà thầu chính được chủ dự án ủy quyền quản lý dự án ODA không hoàn lại được hoàn lại số thuế GTGT đã trả cho hàng hóa, dịch vụ mua tại Việt Nam để phục vụ cho dự án.
• Nhà tài trợ nước ngoài hoặc văn phòng đại diện của nhà tài trợ thực hiện quản lý dự án ODA không hoàn lại cũng thuộc diện được xem xét hoàn thuế GTGT đối với các chi phí mua sắm hàng hóa, dịch vụ phục vụ hoạt động của văn phòng tại Việt Nam.
• Đối với dự án ODA vay vốn ưu đãi, việc hoàn thuế GTGT đầu vào được thực hiện theo cơ chế tài chính của từng dự án cụ thể đã được cấp có thẩm quyền phê duyệt.

2. Điều kiện bắt buộc để được giải quyết hoàn thuế GTGT

• Dự án ODA phải được phê duyệt bởi cơ quan có thẩm quyền và được xác định rõ cơ chế tài chính (không thuộc diện ngân sách nhà nước cấp phát không hoàn lại đối với phần thuế GTGT).
• Có văn bản xác nhận của cơ quan chủ quản dự án về việc dự án thuộc đối tượng được hoàn thuế GTGT đầu vào.
• Các hóa đơn mua hàng hóa, dịch vụ đầu vào phải là hóa đơn hợp pháp (hóa đơn điện tử hoặc hóa đơn giấy theo quy định).
• Có chứng từ thanh toán không dùng tiền mặt đối với các hóa đơn mua hàng hóa, dịch vụ có giá trị từ 20 triệu đồng trở lên.

3. Quy định về hồ sơ đề nghị hoàn thuế GTGT

Hồ sơ hoàn thuế GTGT đối với dự án ODA phải tuân thủ nghiêm ngặt các quy định tại Luật Quản lý thuế và Thông tư số 80/2021/TT-BTC, bao gồm:

• Giấy đề nghị hoàn trả khoản thu ngân sách nhà nước theo mẫu quy định.
• Bản sao quyết định phê duyệt dự án ODA hoặc quyết định đầu tư của cơ quan có thẩm quyền kèm theo văn bản xác nhận của cơ quan chủ quản về nguồn vốn ODA.
• Bảng kê chi tiết các hóa đơn, chứng từ mua hàng hóa, dịch vụ đầu vào phục vụ trực tiếp cho dự án ODA.
• Văn bản ủy quyền hợp pháp trong trường hợp nhà thầu chính hoặc đơn vị được ủy quyền thực hiện thủ tục hoàn thuế thay cho chủ dự án.

4. Trách nhiệm của người nộp thuế và cơ quan thuế

• Đối với người nộp thuế: Phải tự chịu trách nhiệm trước pháp luật về tính chính xác, trung thực và hợp pháp của các hồ sơ, tài liệu và số liệu thuế đề nghị hoàn.
• Đối với cơ quan thuế: Có trách nhiệm tiếp nhận, phân loại hồ sơ hoàn thuế (thuộc diện hoàn thuế trước kiểm tra sau hoặc kiểm tra trước hoàn thuế sau) và thực hiện giải quyết hoàn thuế đúng thời hạn quy định. Trường hợp hồ sơ chưa đủ điều kiện, cơ quan thuế phải có văn bản thông báo rõ lý do cho người nộp thuế.

Hiệu lực thi hành và hướng dẫn áp dụng

Công văn số 46/TCT-CS có hiệu lực hướng dẫn thực hiện kể từ ngày ban hành. Các hướng dẫn tại văn bản này được áp dụng thống nhất đối với các hồ sơ đề nghị hoàn thuế GTGT của dự án ODA đang trong quá trình giải quyết hoặc phát sinh mới, đảm bảo quyền lợi hợp pháp của các nhà đầu tư và nhà thầu theo đúng quy định của pháp luật thuế hiện hành.