Công văn số 5063/TCT-CS do Tổng cục Thuế ban hành là văn bản hướng dẫn quan trọng nhằm giải quyết, tháo gỡ các vướng mắc phát sinh trong quá trình thực hiện Luật Quản lý thuế. Văn bản này đóng vai trò định hướng cho các Cục Thuế địa phương và người nộp thuế áp dụng thống nhất các quy định pháp luật, đảm bảo tính minh bạch, nhất quán và hiệu quả trong công tác quản lý thuế.

Nguyên tắc áp dụng và xử lý vướng mắc chung

• Tổng cục Thuế yêu cầu các cơ quan thuế địa phương tuân thủ nghiêm ngặt các quy định của Luật Quản lý thuế hiện hành, đồng thời chủ động rà soát, phân loại các vướng mắc phát sinh từ thực tế để xử lý theo đúng thẩm quyền.
• Đối với các trường hợp có sự giao thoa hoặc chuyển tiếp giữa quy định cũ và quy định mới, cơ quan thuế cần áp dụng nguyên tắc có lợi cho người nộp thuế và đảm bảo không làm gián đoạn hoạt động sản xuất kinh doanh của doanh nghiệp.
• Tăng cường công tác tuyên truyền, hỗ trợ người nộp thuế nắm bắt kịp thời các điểm mới của Luật Quản lý thuế nhằm hạn chế tối đa sai sót trong quá trình thực hiện nghĩa vụ thuế.

Hướng dẫn về khai thuế, tính thuế và nộp thuế

• Làm rõ phương pháp xác định nghĩa vụ thuế đối với các hoạt động kinh doanh đặc thù, đảm bảo người nộp thuế kê khai đúng, đủ và kịp thời vào ngân sách nhà nước.
• Hướng dẫn chi tiết quy trình xử lý đối với các trường hợp khai sai, khai thiếu và thủ tục điều chỉnh, bổ sung hồ sơ khai thuế theo quy định mới.
• Quy định về địa điểm nộp thuế và cơ chế phối hợp giữa các cơ quan quản lý trong việc thu nộp ngân sách, đặc biệt là đối với các doanh nghiệp có nhiều chi nhánh hoặc hoạt động liên tỉnh.

Xử lý nợ thuế, tiền chậm nộp và tiền phạt

• Quy định cụ thể về các trường hợp được miễn, giảm hoặc khoanh nợ tiền chậm nộp, tiền phạt do nguyên nhân bất khả kháng, thiên tai, dịch bệnh hoặc khó khăn khách quan từ phía thị trường.
• Chuẩn hóa thủ tục và hồ sơ đề nghị xóa nợ thuế, tiền chậm nộp, tiền phạt nhằm tạo điều kiện thuận lợi cho các doanh nghiệp gặp khó khăn tài chính có cơ hội phục hồi sản xuất kinh doanh.
• Các biện pháp cưỡng chế thi hành quyết định hành chính thuế phải được áp dụng linh hoạt, đúng trình tự pháp luật, tránh gây ảnh hưởng tiêu cực dây chuyền đến chuỗi cung ứng của doanh nghiệp.

Công tác hoàn thuế và kiểm tra, thanh tra thuế

• Đẩy mạnh việc áp dụng quản lý rủi ro trong công tác hoàn thuế, phân loại rõ ràng hồ sơ hoàn thuế trước kiểm tra sau và kiểm tra trước hoàn thuế sau để rút ngắn thời gian giải quyết cho người nộp thuế chấp hành tốt pháp luật.
• Tăng cường công tác thanh tra, kiểm tra thuế dựa trên cơ sở phân tích dữ liệu lớn và hệ thống tiêu chí đánh giá rủi ro, hạn chế tối đa việc chồng chéo, trùng lặp và gây phiền hà cho doanh nghiệp.
• Giải quyết dứt điểm các khiếu nại, tố cáo của người nộp thuế liên quan đến hành vi hành chính và quyết định hành chính của cơ quan thuế các cấp.