Công văn số 5412/TCT-CS do Tổng cục Thuế ban hành hướng dẫn về việc kê khai thuế giá trị gia tăng (GTGT), nhằm giải đáp các vướng mắc của người nộp thuế và cơ quan thuế địa phương trong quá trình thực hiện nghĩa vụ khai thuế, khấu trừ và hoàn thuế GTGT theo quy định pháp luật hiện hành.

Phạm vi và đối tượng áp dụng

Văn bản hướng dẫn áp dụng đối với các doanh nghiệp, tổ chức kinh tế có phát sinh hoạt động sản xuất kinh doanh, các đơn vị có dự án đầu tư thuộc diện kê khai thuế GTGT, cùng các Cục Thuế tỉnh, thành phố trực thuộc trung ương chịu trách nhiệm quản lý thuế trực tiếp.

Quy định về kê khai thuế GTGT đối với dự án đầu tư

• Người nộp thuế có dự án đầu tư thuộc diện được hoàn thuế GTGT theo quy định của pháp luật về thuế GTGT phải lập hồ sơ khai thuế GTGT riêng cho từng dự án đầu tư.
• Hồ sơ khai thuế GTGT của dự án đầu tư được thực hiện theo Mẫu số 02/GTGT ban hành kèm theo Thông tư số 80/2021/TT-BTC của Bộ Tài chính.
• Trường hợp dự án đầu tư được thực hiện tại địa bàn khác tỉnh, thành phố trực thuộc trung ương nơi đóng trụ sở chính, người nộp thuế phải nộp hồ sơ khai thuế GTGT của dự án đầu tư cho cơ quan thuế nơi có dự án đầu tư.

Nguyên tắc bù trừ và hoàn thuế GTGT của dự án đầu tư

• Số thuế GTGT đầu vào của dự án đầu tư phải được bù trừ với số thuế GTGT phải nộp của hoạt động sản xuất kinh doanh đang thực hiện tại trụ sở chính (nếu có).
• Mức bù trừ tối đa bằng số thuế GTGT phải nộp của hoạt động sản xuất kinh doanh tại trụ sở chính trong cùng kỳ tính thuế.
• Sau khi thực hiện bù trừ theo quy định, nếu số thuế GTGT đầu vào của dự án đầu tư chưa được khấu trừ hết từ 300 triệu đồng trở lên và đáp ứng đầy đủ các điều kiện hoàn thuế thì người nộp thuế được xem xét hoàn thuế GTGT theo quy định của pháp luật.

Kê khai thuế GTGT đối với đơn vị phụ thuộc và địa điểm kinh doanh

• Đối với các đơn vị phụ thuộc, địa điểm kinh doanh trực tiếp bán hàng, phát sinh doanh thu thì phải thực hiện kê khai, nộp thuế GTGT riêng biệt hoặc phân bổ thuế GTGT theo quy định tại Nghị định số 126/2020/NĐ-CP và Thông tư số 80/2021/TT-BTC.
• Trường hợp đơn vị phụ thuộc không trực tiếp bán hàng, không phát sinh doanh thu thì thực hiện khai thuế tập trung tại trụ sở chính của người nộp thuế.

Hiệu lực thi hành và hướng dẫn thực hiện

Công văn số 5412/TCT-CS có hiệu lực áp dụng kể từ ngày ban hành. Các nội dung hướng dẫn tại công văn này được thực hiện thống nhất cùng với các quy định tại Luật Quản lý thuế, Nghị định số 126/2020/NĐ-CP và Thông tư số 80/2021/TT-BTC nhằm đảm bảo quyền lợi hợp pháp của người nộp thuế và nâng cao hiệu quả quản lý thuế của cơ quan nhà nước.