Công văn số 6401/TCHQ-KTTT do Tổng cục Hải quan ban hành nhằm giải quyết và trả lời các kiến nghị liên quan đến chính sách thuế nhập khẩu đối với Nhà máy lọc dầu Dung Quất. Đây là văn bản hướng dẫn nghiệp vụ quan trọng, giúp tháo gỡ các vướng mắc về thuế, tạo điều kiện thuận lợi cho hoạt động sản xuất kinh doanh của nhà máy lọc dầu trong khuôn khổ pháp luật hải quan.

• Giải quyết các kiến nghị cụ thể của doanh nghiệp quản lý, vận hành Nhà máy lọc dầu Dung Quất về các vấn đề liên quan đến nghĩa vụ thuế nhập khẩu và thủ tục hải quan liên quan.
• Hướng dẫn các Cục Hải quan địa phương thống nhất thực hiện quy trình kiểm tra, tính thuế và áp dụng các ưu đãi thuế nhập khẩu theo đúng quy định của pháp luật hiện hành.
• Đảm bảo sự minh bạch, nhất quán trong việc thực thi chính sách thuế đối với các dự án trọng điểm quốc gia trong lĩnh vực dầu khí.

• Xem xét và làm rõ các điều kiện áp dụng thuế suất ưu đãi đối với nguyên liệu, vật tư, máy móc và thiết bị nhập khẩu phục vụ cho hoạt động sản xuất, bảo dưỡng, vận hành và nâng cấp Nhà máy lọc dầu Dung Quất.
• Hướng dẫn chi tiết về hồ sơ, thủ tục hải quan đối với hàng hóa nhập khẩu thuộc đối tượng ưu đãi thuế hoặc miễn thuế, giảm thiểu thủ tục hành chính cho doanh nghiệp nhưng vẫn đảm bảo công tác quản lý chặt chẽ của cơ quan hải quan.
• Xử lý các vướng mắc phát sinh trong quá trình thông quan hàng hóa, xác định trị giá hải quan và áp mã số hàng hóa (mã HS) đối với các mặt hàng đặc thù của ngành lọc hóa dầu.

• Yêu cầu các Cục Hải quan tỉnh, thành phố liên quan phối hợp chặt chẽ với doanh nghiệp để hướng dẫn chi tiết về thủ tục kê khai, nộp thuế, miễn thuế và hoàn thuế (nếu có) theo đúng quy định pháp luật.
• Tăng cường công tác kiểm tra sau thông quan nhằm đảm bảo việc sử dụng hàng hóa nhập khẩu đúng mục đích đã đăng ký và được hưởng ưu đãi thuế theo quy định.
• Kịp thời tổng hợp và báo cáo Bộ Tài chính những vấn đề phát sinh vượt thẩm quyền để có phương án xử lý dứt điểm, tạo môi trường đầu tư và sản xuất ổn định cho ngành năng lượng.