Ngày 04/11/2003, Bộ Kế hoạch và Đầu tư đã ban hành Công văn số 6758 BKH/ĐTNN hướng dẫn về việc miễn thuế nhập khẩu nguyên liệu đối với các dự án đầu tư mở rộng của doanh nghiệp có vốn đầu tư nước ngoài tại Việt Nam.

Phạm vi và đối tượng áp dụng của văn bản

• Đối tượng áp dụng: Các doanh nghiệp có vốn đầu tư nước ngoài (FDI) đang hoạt động tại Việt Nam có thực hiện các dự án đầu tư mở rộng, tăng năng lực sản xuất, đổi mới công nghệ hoặc phát triển quy mô sản xuất kinh doanh.
• Phạm vi điều chỉnh: Việc xem xét, giải quyết các ưu đãi về thuế nhập khẩu đối với nguyên liệu, vật tư, linh kiện phục vụ cho hoạt động sản xuất của các dự án đầu tư mở rộng theo quy định của pháp luật về đầu tư nước ngoài tại Việt Nam.

- Nguyên tắc áp dụng ưu đãi miễn thuế nguyên liệu cho dự án đầu tư mở rộng

• Dự án đầu tư mở rộng được xác định là một phần không tách rời hoặc là phân xưởng, dây chuyền sản xuất mới của doanh nghiệp có vốn đầu tư nước ngoài, được cơ quan nhà nước có thẩm quyền cấp Giấy phép đầu tư điều chỉnh.
• Ưu đãi miễn thuế nhập khẩu đối với nguyên liệu, vật tư, linh kiện phục vụ sản xuất của dự án đầu tư mở rộng được áp dụng theo các tiêu chuẩn và điều kiện ưu đãi quy định tại Luật Đầu tư nước ngoài tại Việt Nam và các văn bản hướng dẫn thi hành có hiệu lực tại thời điểm điều chỉnh giấy phép.
• Việc miễn thuế nhập khẩu đối với nguyên liệu sản xuất thường được áp dụng trong thời hạn tối đa là 05 năm kể từ khi dự án đầu tư mở rộng bắt đầu đi vào hoạt động sản xuất chính thức, áp dụng đối với những loại nguyên liệu, vật tư, linh kiện trong nước chưa sản xuất được hoặc sản xuất được nhưng chưa đạt tiêu chuẩn chất lượng kỹ thuật yêu cầu.

- Điều kiện và thủ tục để được hưởng ưu đãi thuế

• Doanh nghiệp phải có Giấy phép đầu tư điều chỉnh do cơ quan quản lý nhà nước về đầu tư có thẩm quyền cấp, trong đó ghi rõ nội dung đầu tư mở rộng và các ưu đãi thuế quan được hưởng.
• Doanh nghiệp có trách nhiệm xây dựng và đăng ký danh mục nguyên liệu, vật tư, linh kiện nhập khẩu phục vụ trực tiếp cho dự án đầu tư mở rộng với cơ quan hải quan hoặc cơ quan quản lý có thẩm quyền để làm cơ sở áp dụng miễn thuế.
• Lượng nguyên liệu nhập khẩu được miễn thuế phải phù hợp với công suất thiết kế và tiến độ sản xuất thực tế của dự án đầu tư mở rộng đã được phê duyệt, không được tự ý chuyển nhượng hoặc sử dụng sai mục đích ưu đãi.

- Trách nhiệm của các cơ quan quản lý liên quan

• Bộ Kế hoạch và Đầu tư phối hợp với Bộ Tài chính và Tổng cục Hải quan trong việc giám sát, kiểm tra quá trình nhập khẩu và sử dụng nguyên liệu miễn thuế của các doanh nghiệp, đảm bảo tính minh bạch và đúng quy định pháp luật.
• Các cơ quan hải quan địa phương thực hiện việc thông quan và áp dụng miễn thuế dựa trên danh mục đã được phê duyệt và hồ sơ thực tế của doanh nghiệp, đồng thời tiến hành hậu kiểm khi cần thiết để phòng ngừa các hành vi gian lận thương mại.

Công văn số 6758 BKH/ĐTNN có hiệu lực áp dụng kể từ ngày ký ban hành (04/11/2003), đóng vai trò là cơ sở pháp lý quan trọng giải quyết các vướng mắc về thuế cho doanh nghiệp FDI trong giai đoạn đầu những năm 2000.