Ngày 29 tháng 03 năm 1990, Hội đồng Nhà nước đã ban hành Pháp lệnh sửa đổi Pháp lệnh tổ chức Toà án quân sự năm 1990 nhằm sửa đổi, bổ sung một số điều khoản quan trọng liên quan đến thẩm quyền xét xử, cơ cấu tổ chức, nhân sự và các điều kiện bảo đảm hoạt động của hệ thống Toà án quân sự.

Phạm vi và đối tượng áp dụng

Pháp lệnh này áp dụng đối với hệ thống Toà án quân sự các cấp (bao gồm Toà án quân sự cấp cao và Toà án quân sự khu vực), các quân nhân, bị cáo, đương sự tham gia vào quá trình tố tụng tại Toà án quân sự, cùng các cơ quan, đơn vị quân đội và các chức danh tư pháp liên quan như Thẩm phán, Hội thẩm quân nhân.

Bảo đảm quyền bào chữa của bị cáo và quyền lợi của đương sự

• Quyền bào chữa của bị cáo trước Toà án quân sự được pháp luật bảo đảm. Bị cáo có quyền tự bào chữa hoặc nhờ người khác bào chữa cho mình.
• Trong các trường hợp cụ thể do pháp luật quy định, Toà án quân sự có trách nhiệm yêu cầu Đoàn luật sư cử người bào chữa để bảo vệ quyền lợi cho bị cáo.
• Đối với các đương sự khác trong vụ án, họ có quyền tự mình hoặc nhờ người khác bảo vệ quyền và lợi ích hợp pháp của mình trước Toà án.

Thẩm quyền xét xử của Toà án quân sự cấp cao

• Toà án quân sự cấp cao có thẩm quyền xét xử sơ thẩm đồng thời chung thẩm đối với các vụ án đặc biệt nghiêm trọng, phức tạp.
• Thẩm quyền này cũng áp dụng đối với các vụ án mà bị cáo tại thời điểm phạm tội hoặc khi bị khởi tố có quân hàm cấp tướng, hoặc là người giữ chức vụ từ Chỉ huy trưởng sư đoàn, Cục trưởng và các cấp tương đương trở lên.
• Toà án quân sự cấp cao có quyền lấy lên để xét xử các vụ án vốn thuộc thẩm quyền giải quyết của Toà án quân sự quân khu và cấp tương đương.

Thẩm quyền và cơ cấu tổ chức của Toà án quân sự khu vực

• Toà án quân sự khu vực có thẩm quyền xét xử sơ thẩm các vụ án hình sự về các tội phạm theo quy định tại Điều 145 của Bộ luật tố tụng hình sự, áp dụng đối với bị cáo khi phạm tội hoặc khi bị khởi tố có quân hàm từ Thiếu tá trở xuống, hoặc là người giữ chức vụ từ Phó chỉ huy trưởng trung đoàn và cấp tương đương trở xuống.
• Về cơ cấu tổ chức, Toà án quân sự khu vực bao gồm: Chánh án, các Phó chánh án, các Thẩm phán và Hội thẩm quân nhân.

Quy định về Thẩm phán và Hội thẩm quân nhân

• Thẩm phán Toà án quân sự cấp cao là Thẩm phán Toà án nhân dân tối cao, do Hội đồng Nhà nước cử dựa trên đề nghị của Chủ tịch Hội đồng Nhà nước.
• Hội thẩm quân nhân có nhiệm vụ tham gia trực tiếp vào công tác xét xử của Toà án quân sự.
• Các đơn vị quân đội có người được bầu hoặc cử làm Hội thẩm quân nhân có trách nhiệm tạo mọi điều kiện thuận lợi để họ hoàn thành tốt nhiệm vụ xét xử, đồng thời các Hội thẩm quân nhân phải được bồi dưỡng nghiệp vụ về công tác xét xử.

Bảo đảm kinh phí và điều kiện hoạt động

• Toàn bộ kinh phí, phương tiện hoạt động và trụ sở làm việc của các Toà án quân sự do Bộ Quốc phòng và các đơn vị quân đội chịu trách nhiệm bảo đảm đầy đủ.

Hiệu lực thi hành và hướng dẫn thực hiện

Pháp lệnh có hiệu lực kể từ ngày ký ban hành (ngày 29 tháng 03 năm 1990). Chánh án Toà án nhân dân tối cao, Bộ trưởng Bộ Tư pháp và Bộ trưởng Bộ Quốc phòng chịu trách nhiệm phối hợp hướng dẫn thi hành chi tiết Pháp lệnh này.