Tóm tắt Công văn 10051/CT-TTHT năm 2017 về hoàn thuế giá trị gia tăng đối với hàng hóa nhập khẩu nộp thừa

Công văn 10051/CT-TTHT do Cục Thuế Thành phố Hồ Chí Minh ban hành nhằm hướng dẫn các doanh nghiệp và cơ quan thuế trực thuộc thực hiện đúng quy định pháp luật về việc xử lý, hoàn trả khoản thuế giá trị gia tăng (GTGT) nộp thừa tại khâu nhập khẩu. Đây là văn bản hướng dẫn nghiệp vụ quan trọng giúp tháo gỡ các vướng mắc liên quan đến thẩm quyền giải quyết và quy trình phối hợp giữa cơ quan Thuế và cơ quan Hải quan.

- Thẩm quyền giải quyết hoàn trả tiền thuế GTGT nộp thừa khâu nhập khẩu

Theo quy định của Luật Quản lý thuế và các văn bản hướng dẫn thi hành, việc xác định và xử lý khoản thuế GTGT nộp thừa phát sinh ở khâu nhập khẩu thuộc thẩm quyền của cơ quan Hải quan. Cụ thể:

• Cơ quan Hải quan nơi người nộp thuế đăng ký tờ khai hải quan và nộp thuế có trách nhiệm tiếp nhận hồ sơ, kiểm tra, đối chiếu dữ liệu và ban hành quyết định hoàn trả tiền thuế GTGT nộp thừa cho doanh nghiệp.
• Cơ quan Thuế không có thẩm quyền trực tiếp ra quyết định hoàn trả đối với số thuế GTGT nộp thừa phát sinh tại khâu nhập khẩu mà chỉ thực hiện khấu trừ hoặc hoàn thuế theo quy trình hoàn thuế GTGT nội địa sau khi các thủ tục điều chỉnh liên quan đã được hoàn tất.

- Nguyên tắc xử lý khi doanh nghiệp đã kê khai, khấu trừ thuế tại cơ quan Thuế

Đối với trường hợp doanh nghiệp đã thực hiện kê khai, khấu trừ số thuế GTGT nộp thừa khâu nhập khẩu tại tờ khai thuế GTGT nộp cho cơ quan Thuế quản lý trực tiếp, việc xử lý được thực hiện theo nguyên tắc sau:

• Doanh nghiệp phải thực hiện kê khai điều chỉnh giảm số thuế GTGT đầu vào đã khấu trừ tương ứng với số thuế nộp thừa được cơ quan Hải quan xác định hoàn trả. Việc kê khai điều chỉnh này nhằm đảm bảo không xảy ra tình trạng trùng lặp quyền lợi (vừa được khấu trừ tại cơ quan Thuế, vừa được hoàn trả tại cơ quan Hải quan).
• Thời điểm kê khai điều chỉnh giảm được thực hiện tại kỳ tính thuế phát sinh việc điều chỉnh hoặc kỳ nhận được quyết định hoàn thuế, văn bản xác nhận số thuế nộp thừa của cơ quan Hải quan.
• Sau khi doanh nghiệp đã hoàn thành việc kê khai điều chỉnh giảm số thuế GTGT đầu vào tại cơ quan Thuế, cơ quan Hải quan mới thực hiện các thủ tục hoàn trả hoặc bù trừ số thuế GTGT nộp thừa khâu nhập khẩu theo quy định.

- Cơ chế phối hợp thông tin giữa cơ quan Thuế và cơ quan Hải quan

Để đảm bảo công tác quản lý thuế chặt chẽ, tránh thất thu ngân sách nhà nước và tạo điều kiện thuận lợi cho người nộp thuế, hai cơ quan thực hiện phối hợp như sau:

• Khi tiếp nhận hồ sơ đề nghị hoàn trả tiền thuế GTGT nộp thừa khâu nhập khẩu, cơ quan Hải quan sẽ tiến hành đối chiếu dữ liệu trên hệ thống thông tin chuyên ngành.
• Trong trường hợp cần xác minh thông tin kê khai của doanh nghiệp, cơ quan Hải quan sẽ gửi văn bản trao đổi thông tin với cơ quan Thuế quản lý trực tiếp để xác định xem doanh nghiệp đã kê khai, khấu trừ hoặc hoàn thuế đối với số thuế GTGT nhập khẩu đó hay chưa.
• Cơ quan Thuế có trách nhiệm kiểm tra tình trạng kê khai của doanh nghiệp và phản hồi bằng văn bản cho cơ quan Hải quan trong thời hạn quy định để làm cơ sở giải quyết hồ sơ hoàn thuế cho người nộp thuế.