Công văn 1021/TCT/NV5 do Tổng cục Thuế ban hành hướng dẫn về việc hoàn thuế giá trị gia tăng (GTGT) đối với các đơn vị hoạt động trong lĩnh vực vận tải. Đây là văn bản hướng dẫn nghiệp vụ quan trọng nhằm tháo gỡ các vướng mắc trong quá trình khấu trừ và hoàn thuế GTGT cho các doanh nghiệp, hợp tác xã vận tải.

Phạm vi và đối tượng áp dụng

Văn bản áp dụng đối với các cơ quan thuế các cấp trong quá trình quản lý, kiểm tra hồ sơ hoàn thuế và các đơn vị, doanh nghiệp, hợp tác xã kinh doanh dịch vụ vận tải hành khách, vận tải hàng hóa có phát sinh hoạt động đề nghị hoàn thuế GTGT.

Điều kiện khấu trừ và hoàn thuế GTGT đầu vào đối với đơn vị vận tải

• Đơn vị vận tải phải có đầy đủ hóa đơn GTGT hợp pháp của hàng hóa, dịch vụ mua vào phục vụ trực tiếp cho hoạt động kinh doanh vận tải như xăng dầu, phụ tùng thay thế, chi phí sửa chữa phương tiện, chi phí mua sắm xe mới.
• Phải có chứng từ thanh toán không dùng tiền mặt đối với các hóa đơn mua vào có giá trị từ mức quy định trở lên theo quy định của pháp luật thuế GTGT hành chính hiện hành.
• Các phương tiện vận tải tham gia hoạt động kinh doanh phải thuộc quyền sở hữu hợp pháp hoặc quyền sử dụng hợp pháp của đơn vị vận tải (thể hiện qua giấy đăng ký xe, hợp đồng thuê phương tiện, hợp đồng hợp tác kinh doanh).

Xác định thuế GTGT đầu ra và áp dụng thuế suất đối với dịch vụ vận tải

• Doanh thu dịch vụ vận tải được xác định dựa trên giá cước vận chuyển, giá vé thực tế thu được từ khách hàng theo hóa đơn đã xuất.
• Đối với hoạt động vận tải quốc tế, đơn vị vận tải được áp dụng mức thuế suất thuế GTGT 0% nếu đáp ứng đầy đủ các điều kiện về hợp đồng vận chuyển hành khách hoặc hàng hóa quốc tế, chứng từ thanh toán qua ngân hàng và các giấy tờ thông quan, xuất nhập cảnh của phương tiện theo quy định.

Nguyên tắc phân bổ thuế GTGT đầu vào được khấu trừ

• Trường hợp đơn vị vận tải phát sinh cả hoạt động chịu thuế GTGT và hoạt động không chịu thuế GTGT, đơn vị phải thực hiện hạch toán riêng thuế GTGT đầu vào được khấu trừ và không được khấu trừ.
• Trong trường hợp không thể hạch toán riêng biệt, số thuế GTGT đầu vào được khấu trừ sẽ được phân bổ theo tỷ lệ phần trăm (%) giữa doanh thu của hoạt động chịu thuế GTGT so với tổng doanh thu của tất cả các hoạt động trong kỳ.

Hồ sơ và thủ tục đề nghị hoàn thuế GTGT

• Giấy đề nghị hoàn trả khoản thu ngân sách nhà nước theo mẫu quy định của cơ quan thuế.
• Bảng kê chi tiết các hóa đơn, chứng từ hàng hóa dịch vụ mua vào và bán ra trong kỳ đề nghị hoàn thuế.
• Các tài liệu, chứng từ chứng minh quyền sử dụng phương tiện vận tải và chứng từ thanh toán không dùng tiền mặt đối với các giao dịch mua vào có giá trị lớn.

Hiệu lực thi hành

Công văn 1021/TCT/NV5 có hiệu lực áp dụng đối với các hồ sơ hoàn thuế GTGT của đơn vị vận tải kể từ ngày ban hành. Các hướng dẫn tại văn bản này được thực hiện thống nhất tại các Cục Thuế địa phương nhằm đảm bảo quyền lợi hợp pháp cho doanh nghiệp vận tải đồng thời ngăn chặn các hành vi gian lận thuế.