Công văn 1809/TCHQ-TXNK do Tổng cục Hải quan ban hành năm 2024 là văn bản hướng dẫn nghiệp vụ quan trọng nhằm giải quyết các vướng mắc phát sinh trong quá trình thực hiện thủ tục thuế đối với hàng hóa xuất khẩu, nhập khẩu. Văn bản hướng tới mục tiêu thống nhất áp dụng pháp luật thuế, tạo điều kiện thuận lợi cho doanh nghiệp đồng thời nâng cao hiệu quả quản lý nhà nước của cơ quan hải quan.

Công văn tập trung xử lý và hướng dẫn chi tiết các nhóm vấn đề cốt lõi sau đây:

• Thủ tục hoàn thuế và không thu thuế: Hướng dẫn cụ thể về hồ sơ, trình tự và điều kiện để doanh nghiệp được hoàn thuế hoặc không thu thuế đối với các trường hợp hàng hóa nhập khẩu nhưng phải tái xuất, hàng xuất khẩu phải tái nhập, hoặc nguyên liệu nhập khẩu để sản xuất xuất khẩu nhưng thay đổi mục đích sử dụng.
• Xử lý tiền thuế nộp thừa: Quy định rõ quy trình đối chiếu, xác nhận và hoàn trả tiền thuế, tiền chậm nộp, tiền phạt nộp thừa cho người nộp thuế. Tổng cục Hải quan yêu cầu các đơn vị hải quan địa phương thực hiện nhanh chóng, đúng thời hạn quy định để tránh gây nghẽn dòng vốn của doanh nghiệp.
• Kiểm tra điều kiện miễn thuế, giảm thuế: Hướng dẫn cơ quan hải quan các cấp tăng cường công tác kiểm tra hồ sơ, đối chiếu thực tế hàng hóa để đảm bảo việc miễn thuế, giảm thuế được thực hiện đúng đối tượng, đúng mục đích, ngăn chặn các hành vi trục lợi chính sách.
• Áp dụng mã số HS và thuế suất: Thống nhất cách thức phân loại hàng hóa và áp dụng mức thuế suất đối với một số mặt hàng phức tạp, dễ gây tranh chấp giữa cơ quan hải quan và doanh nghiệp trong quá trình thông quan.

Để đảm bảo tính đồng bộ trong triển khai thực hiện, Tổng cục Hải quan yêu cầu Cục Hải quan các tỉnh, thành phố thực hiện các nhiệm vụ sau:

• Rà soát và giải quyết hồ sơ tồn đọng: Chủ động rà soát toàn bộ các hồ sơ hoàn thuế, miễn thuế còn tồn đọng để giải quyết dứt điểm cho doanh nghiệp theo đúng thẩm quyền và quy trình pháp luật.
• Tuyên truyền và hỗ trợ người nộp thuế: Phổ biến rộng rãi nội dung hướng dẫn tại Công văn này đến các doanh nghiệp hoạt động trên địa bàn quản lý; kịp thời giải đáp các vướng mắc phát sinh trong quá trình thực hiện khai báo thuế điện tử.
• Tăng cường thanh tra, kiểm tra: Thực hiện kiểm tra sau thông quan đối với các trường hợp có dấu hiệu rủi ro cao về thuế, đảm bảo thu đúng, thu đủ vào ngân sách nhà nước.

Doanh nghiệp hoạt động trong lĩnh vực xuất nhập khẩu cần lưu ý các điểm sau để đảm bảo quyền lợi hợp pháp:

• Tự kê khai và tự chịu trách nhiệm: Doanh nghiệp phải chủ động nghiên cứu kỹ các hướng dẫn về hồ sơ hoàn thuế, miễn thuế để chuẩn bị chứng từ chính xác, trung thực trước khi nộp cho cơ quan hải quan.
• Tuân thủ thời hạn nộp hồ sơ: Thực hiện nộp hồ sơ hoàn thuế, xử lý tiền thuế nộp thừa đúng thời hạn quy định để tránh phát sinh các khoản phạt hoặc bị từ chối giải quyết do quá hạn.