Công văn 416/TCT-CS năm 2015 do Tổng cục Thuế ban hành hướng dẫn về chính sách thuế giá trị gia tăng (GTGT) đối với khoản phí phát hành chứng chỉ quỹ mở. Đây là văn bản hướng dẫn nghiệp vụ quan trọng giúp các công ty quản lý quỹ và các đại lý phân phối xác định rõ nghĩa vụ thuế đối với hoạt động kinh doanh chứng khoán đặc thù này.

Căn cứ vào các quy định pháp luật về thuế GTGT, Tổng cục Thuế làm rõ phạm vi áp dụng đối với các dịch vụ tài chính, chứng khoán như sau:

• Theo quy định tại Luật Thuế giá trị gia tăng và các văn bản hướng dẫn thi hành (đặc biệt là Thông tư số 219/2013/TT-BTC của Bộ Tài chính), hoạt động kinh doanh chứng khoán thuộc đối tượng không chịu thuế GTGT.
• Các dịch vụ kinh doanh chứng khoán được xác định bao gồm: môi giới chứng khoán, tự doanh chứng khoán, bảo lãnh phát hành chứng khoán, tư vấn đầu tư chứng khoán, lưu ký chứng khoán, quản lý quỹ đầu tư chứng khoán, quản lý danh mục đầu tư chứng khoán, dịch vụ tổ chức thị trường của sở giao dịch chứng khoán hoặc trung tâm giao dịch chứng khoán, và các hoạt động kinh doanh chứng khoán khác theo quy định của pháp luật về chứng khoán.

Trên cơ sở đối chiếu các quy định pháp lý về chứng khoán và thuế, Tổng cục Thuế đưa ra hướng dẫn cụ thể đối với trường hợp phát hành chứng chỉ quỹ mở:

• Hoạt động phát hành chứng chỉ quỹ mở của quỹ đại chúng (do công ty quản lý quỹ thực hiện hoặc thông qua các đại lý phân phối được ủy quyền) được xác định là một phần trong hoạt động quản lý quỹ đầu tư chứng khoán và kinh doanh chứng khoán.
• Khoản phí phát hành chứng chỉ quỹ mở mà công ty quản lý quỹ hoặc các tổ chức phân phối thu từ nhà đầu tư khi thực hiện giao dịch mua chứng chỉ quỹ thuộc đối tượng không chịu thuế GTGT.
• Quy định này áp dụng thống nhất cho cả công ty quản lý quỹ trực tiếp thực hiện phát hành và các tổ chức tín dụng, công ty chứng khoán đóng vai trò là đại lý phân phối chứng chỉ quỹ được ủy quyền hợp pháp.

Để đảm bảo việc thực hiện đúng quy trình thủ tục hành chính thuế, Tổng cục Thuế hướng dẫn các đơn vị liên quan thực hiện lập hóa đơn và kê khai như sau:

• Khi thu phí phát hành chứng chỉ quỹ mở từ nhà đầu tư, công ty quản lý quỹ hoặc đại lý phân phối phải lập hóa đơn theo quy định của pháp luật về hóa đơn bán hàng hóa, cung ứng dịch vụ.
• Trên hóa đơn giá trị gia tăng, tại dòng thuế suất và tiền thuế GTGT, đơn vị thực hiện gạch chéo (/) hoặc ghi rõ là "không chịu thuế" theo đúng hướng dẫn đối với đối tượng không chịu thuế GTGT.
• Các đơn vị thực hiện kê khai các khoản doanh thu từ phí phát hành chứng chỉ quỹ mở vào chỉ tiêu doanh thu hàng hóa, dịch vụ bán ra không chịu thuế trên tờ khai thuế GTGT định kỳ gửi cơ quan thuế quản lý trực tiếp.