Kính gửi: Cục Thuế các tỉnh, thành phố trực thuộc Trung ương

Thực hiện Luật số 106/2016/QH13 ngày 06/4/2016 của Quốc Hội sửa đổi, bổ sung một số điều của Luật thuế giá trị gia tăng, Luật thuế tiêu thụ đặc biệt và Luật quản lý thuế và các văn bản hướng dẫn thi hành Luật; Thông tư số 99/2016/TT-BTC ngày 29/6/2016 của Bộ Tài chính hướng dẫn về quản lý hoàn thuế giá trị gia tăng. Ngày 30/9/2016, Bộ Tài chính đã có công văn số 13804/BTC-TCT về việc quản lý hoàn thuế GTGT các tháng cuối năm 2016 (sau đây gọi là công văn 13804/BTC-TCT); sau khi báo cáo và được sự đồng ý của Bộ Tài chính, Tổng cục Thuế hướng dẫn cụ thể như sau:

1. Tổng cục Thuế thực hiện giám sát về thủ tục hồ sơ đối với các trường hợp hoàn thuế nêu tại điểm 1 Công văn số 13804/BTC-TCT: Cục Thuế có trách nhiệm cập nhật đầy đủ hồ sơ theo quy định tại khoản 2 Điều 15 Thông tư số 99/2016/TT-BTC và gửi đề nghị Tổng cục Thuế thực hiện giám sát theo quy định tại điểm 2 Công văn số 13804/BTC-TCT. Căn cứ thông báo kết quả giám sát của Tổng cục Thuế là “đủ điều kiện ban hành quyết định”, Cục Thuế mới được ban hành Quyết định hoàn thuế.

2. Đối với các hồ sơ hoàn thuế thuộc các trường hợp nêu tại điểm 3 Công văn số 13804/BTC-TCT: Cục Thuế ban hành Quyết định hoàn thuế trong trường hợp kết quả giám sát tự động của Hệ thống TMS có kết quả “Đạt” đối với tất cả các chỉ tiêu thuộc diện giám sát (giám sát lần đầu và giám sát lại).

Kể từ ngày công văn này được ký ban hành, Cục Thuế không được phân quyền chức năng cập nhật kết quả cho từng tiêu chí giám sát từ “Không đạt” thành “Đạt” trên Hệ thống TMS. Trường hợp hồ sơ hoàn thuế có ít nhất một chỉ tiêu “Không đạt” do nguyên nhân khách quan, Cục Thuế phải đề nghị Tổng cục Thuế thực hiện giám sát trực tiếp và gửi văn bản giải trình đối với từng tiêu chí để Tổng cục Thuế thực hiện chức năng giám sát trên Hệ thống TMS. Căn cứ thông báo kết quả giám sát của Tổng cục Thuế, Cục Thuế ban hành Quyết định hoàn thuế nếu kết quả giám sát là “đủ điều kiện ban hành quyết định”.

3. Việc gửi, tiếp nhận, thông báo kết quả giám sát hoàn thuế giữa Tổng cục Thuế và Cục Thuế được thực hiện theo hướng dẫn của Tổng cục Thuế (tại điểm 3 Công văn số 4226/TCT-KK ngày 13/10/2015 về việc thực hiện giám sát hoàn thuế giá trị gia tăng của Tổng cục Thuế).

4. Cục Thuế có trách nhiệm cập nhật, hạch toán đầy đủ các Quyết định hoàn thuế/ Quyết định hoàn thuế kiêm bù trừ khoản thu ngân sách nhà nước vào Hệ thống TMS sau khi được ký ban hành chậm nhất ngay trong ngày làm việc.

Cục Thuế chỉ được lưu hành Quyết định hoàn thuế/Quyết định hoàn thuế kiêm bù trừ thu NSNN, Lệnh hoàn thuế/Lệnh hoàn kiêm bù trừ khoản thu NSNN đối với hoàn thuế GTGT sau khi đã hạch toán Quyết định hoàn thuế/Quyết định hoàn thuế kiêm bù trừ thu NSNN (là các quyết định đủ điều kiện ban hành).

5. Định kỳ 2 lần một ngày làm việc, Tổng cục Thuế kết xuất Bảng kê các Quyết định hoàn thuế/ Quyết định hoàn thuế kiêm bù trừ khoản thu ngân sách nhà nước đã được hạch toán vào Hệ thống TMS gửi thư điện tử cho Kho bạc Nhà nước có gắn chữ ký số, thời điểm bắt đầu thực hiện kể từ ngày 10/10/2016.

Trong quá trình thực hiện gặp vướng mắc đề nghị Cục Thuế báo cáo, phản ánh về Tổng cục Thuế (Vụ Kê khai và Kế toán thuế, Cục Công nghệ thông tin) để được giải quyết kịp thời.

Tổng cục Thuế thông báo để Cục Thuế các tỉnh, thành phố biết và thực hiện./.