Công văn 6052/TCT-CS do Tổng cục Thuế ban hành hướng dẫn về chính sách thuế giá trị gia tăng (GTGT) đối với dự án đầu tư, tập trung làm rõ mối liên hệ chặt chẽ giữa thủ tục pháp lý về đầu tư và điều kiện để doanh nghiệp được hoàn thuế GTGT. Văn bản đưa ra các căn cứ pháp lý quan trọng từ Luật Đầu tư, Nghị định hướng dẫn thi hành và Thông tư về thuế để giải quyết vướng mắc thực tế của địa phương.

Thủ tục đăng ký đầu tư đối với dự án đầu tư trong nước

Theo các quy định được viện dẫn, việc thực hiện thủ tục đăng ký đầu tư đối với các dự án trong nước được phân loại cụ thể dựa trên quy mô vốn và điều kiện lĩnh vực đầu tư:

• Đối với dự án đầu tư trong nước có quy mô vốn đầu tư dưới 15 tỷ đồng Việt Nam và không thuộc Danh mục lĩnh vực đầu tư có điều kiện: Nhà đầu tư được miễn trừ, không phải thực hiện thủ tục đăng ký đầu tư.
• Đối với dự án đầu tư trong nước có quy mô vốn đầu tư từ 15 tỷ đồng Việt Nam đến dưới 300 tỷ đồng Việt Nam và không thuộc Danh mục lĩnh vực đầu tư có điều kiện: Nhà đầu tư bắt buộc phải thực hiện thủ tục đăng ký đầu tư theo mẫu quy định tại cơ quan nhà nước quản lý đầu tư cấp tỉnh.

Trường hợp thực hiện thủ tục cấp Giấy chứng nhận đăng ký đầu tư theo Luật Đầu tư 2014

Căn cứ theo quy định tại Điều 36 Luật Đầu tư số 67/2014/QH13, việc cấp Giấy chứng nhận đăng ký đầu tư được phân định rõ ràng giữa các đối tượng thực hiện dự án:

• Các trường hợp phải thực hiện thủ tục cấp Giấy chứng nhận đăng ký đầu tư: Áp dụng đối với dự án đầu tư của nhà đầu tư nước ngoài; và dự án đầu tư của tổ chức kinh tế thuộc trường hợp quy định tại khoản 1 Điều 23 Luật Đầu tư 2014 khi thành lập tổ chức kinh tế, góp vốn, mua cổ phần, phần vốn góp.
• Các trường hợp không phải thực hiện thủ tục cấp Giấy chứng nhận đăng ký đầu tư: Áp dụng đối với dự án đầu tư của nhà đầu tư trong nước; dự án đầu tư của tổ chức kinh tế quy định tại khoản 2 Điều 23 Luật Đầu tư 2014; và các hoạt động đầu tư theo hình thức góp vốn, mua cổ phần, phần vốn góp của tổ chức kinh tế.

Quy định chuyển tiếp đối với các dự án thực hiện trước ngày Luật Đầu tư 2014 có hiệu lực

Để bảo đảm quyền lợi hợp pháp của nhà đầu tư, vấn đề chuyển tiếp pháp lý được giải quyết đồng bộ thông qua Luật Đầu tư 2014 và Nghị định số 118/2015/NĐ-CP:

• Theo Khoản 2 Điều 74 Luật Đầu tư 2014, nhà đầu tư đã thực hiện dự án trước ngày Luật này có hiệu lực thuộc diện phải cấp Giấy chứng nhận đăng ký đầu tư hoặc quyết định chủ trương đầu tư thì không bắt buộc phải làm thủ tục này. Trường hợp nhà đầu tư có nhu cầu, cơ quan nhà nước sẽ thực hiện cấp Giấy chứng nhận đăng ký đầu tư theo quy định mới.
• Theo Điều 59 Nghị định số 118/2015/NĐ-CP, nhà đầu tư được tiếp tục thực hiện dự án theo Giấy phép đầu tư, Giấy chứng nhận ưu đãi đầu tư, Giấy chứng nhận đầu tư hoặc các giấy tờ có giá trị pháp lý tương đương đã được cấp trước ngày Luật Đầu tư có hiệu lực. Các văn bản này có giá trị pháp lý tương đương Giấy chứng nhận đăng ký đầu tư.
• Nhà đầu tư không phải thực hiện thủ tục cấp Giấy chứng nhận đăng ký đầu tư hay quyết định chủ trương đầu tư đối với các dự án đã thực hiện hoặc đã được cơ quan nhà nước có thẩm quyền chấp thuận chủ trương, cho phép thực hiện trước ngày Luật Đầu tư 2014 có hiệu lực thi hành.

Điều kiện hoàn thuế giá trị gia tăng đối với dự án đầu tư

Mối liên kết giữa pháp luật đầu tư và chính sách hoàn thuế GTGT được quy định cụ thể tại Điều 18 Thông tư số 219/2013/TT-BTC của Bộ Tài chính:

• Dự án đầu tư được hoàn thuế GTGT phải là dự án được cơ quan có thẩm quyền phê duyệt theo đúng quy định của pháp luật về đầu tư.
• Trong trường hợp dự án đầu tư không thuộc đối tượng bắt buộc phải phê duyệt theo quy định của pháp luật về đầu tư, dự án đó phải có phương án đầu tư được người có thẩm quyền ra quyết định đầu tư phê duyệt.

Ý kiến chỉ đạo và hướng dẫn xử lý của Tổng cục Thuế

Qua xem xét công văn số 14407/CT-THNVDT của Cục Thuế tỉnh Bình Dương, Tổng cục Thuế nhận thấy nội dung báo cáo chưa cung cấp đầy đủ các thông tin cốt lõi để đưa ra phán quyết cuối cùng, cụ thể là chưa nêu rõ: đơn vị nào là chủ đầu tư thực tế của dự án; lĩnh vực đầu tư và tiến độ thực hiện dự án; dự án đầu tư có thuộc đối tượng được phê duyệt theo pháp luật đầu tư hay có phương án đầu tư được người có thẩm quyền phê duyệt hay không.

Do đó, Tổng cục Thuế yêu cầu Cục Thuế tỉnh Bình Dương căn cứ vào các quy định pháp luật nêu trên, kết hợp với việc kiểm tra, xác minh tình hình thực tế của doanh nghiệp để đưa ra hướng dẫn cụ thể, bảo đảm thực hiện đúng chính sách thuế GTGT và pháp luật đầu tư hiện hành.