Công văn 7222/TCHQ-KTTT do Tổng cục Hải quan ban hành là văn bản hướng dẫn nghiệp vụ quan trọng liên quan đến việc lưu trữ, xuất trình và kiểm tra hóa đơn giá trị gia tăng (GTGT) đối với hàng hóa xuất khẩu. Văn bản này nhằm tháo gỡ các vướng mắc của doanh nghiệp và cơ quan hải quan địa phương, đảm bảo sự thống nhất trong việc thực hiện thủ tục hải quan, quản lý thuế và kiểm tra sau thông quan.

• Quy định về chứng từ trong hồ sơ hải quan: Đối với hàng hóa xuất khẩu, chứng từ bắt buộc trong hồ sơ hải quan thông thường là hóa đơn thương mại (commercial invoice). Hóa đơn GTGT nội địa không bắt buộc phải nộp hoặc xuất trình tại thời điểm làm thủ tục thông quan, trừ các trường hợp đặc thù theo quy định của pháp luật.
• Trách nhiệm lưu trữ hóa đơn của doanh nghiệp: Doanh nghiệp xuất khẩu có nghĩa vụ lưu trữ đầy đủ hóa đơn GTGT (bao gồm cả hóa đơn điện tử hoặc hóa đơn giấy hợp pháp) tại trụ sở doanh nghiệp. Việc lưu trữ phải tuân thủ nghiêm ngặt các quy định của Luật Kế toán, Luật Quản lý thuế và các văn bản hướng dẫn thi hành để phục vụ công tác thanh tra, kiểm tra sau này.
• Công tác kiểm tra và đối chiếu của cơ quan Hải quan: Trong quá trình kiểm tra sau thông quan hoặc khi có nghi ngờ về tính trung thực của lô hàng xuất khẩu, cơ quan Hải quan có quyền yêu cầu doanh nghiệp xuất trình hóa đơn GTGT để đối chiếu với hóa đơn thương mại và tờ khai hải quan. Điều này nhằm ngăn chặn các hành vi gian lận thương mại, khai khống trị giá hải quan hoặc hoàn thuế GTGT bất hợp pháp.
• Sự phối hợp liên ngành giữa Hải quan và Thuế: Công văn định hướng việc tăng cường chia sẻ dữ liệu điện tử giữa cơ quan Hải quan và cơ quan Thuế để kiểm tra chéo thông tin hóa đơn, giảm thiểu phiền hà cho doanh nghiệp nhưng vẫn đảm bảo hiệu quả quản lý nhà nước.

• Tối ưu hóa quy trình thông quan: Doanh nghiệp được tạo điều kiện thuận lợi khi không phải nộp hóa đơn GTGT ở khâu thông quan, giúp rút ngắn thời gian giải phóng hàng hóa.
• Nâng cao tính tự tuân thủ: Doanh nghiệp phải tự chịu trách nhiệm hoàn toàn về tính hợp pháp, hợp lệ của hóa đơn GTGT đã phát hành và lưu trữ. Mọi sai lệch giữa hóa đơn GTGT và hồ sơ hải quan đều có thể dẫn đến rủi ro bị xử phạt hành chính hoặc truy thu thuế.
• Chuẩn bị kỹ lưỡng cho kiểm tra sau thông quan: Doanh nghiệp cần thiết lập hệ thống lưu trữ chứng từ khoa học, đảm bảo có thể cung cấp ngay hóa đơn GTGT và các chứng từ liên quan khi có yêu cầu thanh tra từ cơ quan có thẩm quyền.