Công văn của Tổng cục Thuế hướng dẫn về việc khấu trừ thuế giá trị gia tăng (GTGT) là văn bản nghiệp vụ quan trọng nhằm tháo gỡ các vướng mắc thực tế, hướng dẫn thống nhất cách áp dụng quy định pháp luật về thuế GTGT cho các doanh nghiệp và cơ quan thuế các cấp.

Phạm vi và đối tượng áp dụng: Hướng dẫn này áp dụng đối với các tổ chức, cá nhân nộp thuế GTGT theo phương pháp khấu trừ thuế có phát sinh hoạt động mua sắm hàng hóa, dịch vụ phục vụ sản xuất kinh doanh; các cơ quan thuế địa phương thực hiện công tác quản lý, thanh tra, kiểm tra thuế và các tổ chức, cá nhân khác có liên quan.

Điều kiện khấu trừ thuế giá trị gia tăng đầu vào:

• Phải có hóa đơn giá trị gia tăng hợp pháp của hàng hóa, dịch vụ mua vào hoặc chứng từ nộp thuế giá trị gia tăng khâu nhập khẩu, chứng từ nộp thuế GTGT thay cho phía nước ngoài theo quy định của Bộ Tài chính.
• Phải có chứng từ thanh toán không dùng tiền mặt đối với hàng hóa, dịch vụ mua vào (bao gồm cả hàng hóa nhập khẩu) từ hai mươi triệu đồng trở lên, trừ các trường hợp giá trị hàng hóa, dịch vụ mua vào từng lần theo hóa đơn dưới hai mươi triệu đồng đã bao gồm thuế GTGT.
• Trường hợp mua hàng hóa, dịch vụ của một nhà cung cấp có giá trị dưới hai mươi triệu đồng nhưng mua nhiều lần trong cùng một ngày có tổng trị giá từ hai mươi triệu đồng trở lên thì chỉ được khấu trừ thuế đối với trường hợp có chứng từ thanh toán không dùng tiền mặt hợp lệ.

Nguyên tắc khấu trừ thuế giá trị gia tăng đầu vào:

• Thuế GTGT đầu vào của hàng hóa, dịch vụ dùng cho sản xuất, kinh doanh hàng hóa, dịch vụ chịu thuế GTGT được khấu trừ toàn bộ, bao gồm cả thuế GTGT đầu vào không được bồi thường của hàng hóa hóa bị tổn thất.
• Thuế GTGT đầu vào của hàng hóa, dịch vụ sử dụng đồng thời cho sản xuất, kinh doanh hàng hóa, dịch vụ chịu thuế và không chịu thuế GTGT thì chỉ được khấu trừ số thuế GTGT đầu vào của hàng hóa, dịch vụ dùng cho sản xuất, kinh doanh hàng hóa, dịch vụ chịu thuế GTGT. Doanh nghiệp phải hạch toán riêng thuế GTGT đầu vào được khấu trừ và không được khấu trừ.
• Trường hợp không hạch toán riêng được, thuế đầu vào được khấu trừ tính theo tỷ lệ phần trăm (%) giữa doanh thu chịu thuế GTGT, doanh thu không phải kê khai, tính nộp thuế GTGT so với tổng doanh thu của hàng hóa, dịch vụ bán ra.
• Thuế GTGT đầu vào của tài sản cố định, máy móc, thiết bị dùng đồng thời cho sản xuất, kinh doanh hàng hóa, dịch vụ chịu thuế GTGT và không chịu thuế GTGT thì được khấu trừ toàn bộ.

Các trường hợp không được khấu trừ thuế giá trị gia tăng:

• Sử dụng hóa đơn GTGT không đúng quy định của pháp luật, hóa đơn không ghi thuế GTGT (trừ trường hợp đặc thù), hóa đơn giả, hóa đơn khống hoặc hóa đơn ghi không đúng thông tin của bên mua và bên bán.
• Không có chứng từ thanh toán không dùng tiền mặt hợp lệ đối với các giao dịch có giá trị từ hai mươi triệu đồng trở lên.
• Thuế GTGT đầu vào của tài sản cố định, vật tư, hàng hóa, dịch vụ vượt định mức tiêu hao theo quy định pháp luật hoặc không phục vụ trực tiếp cho hoạt động sản xuất kinh doanh của doanh nghiệp.

Hiệu lực thi hành: Văn bản hướng dẫn nghiệp vụ này được áp dụng đồng bộ với các quy định pháp luật về thuế GTGT hiện hành. Các cơ quan thuế địa phương và người nộp thuế có trách nhiệm đối chiếu, thực hiện đúng theo các nội dung hướng dẫn của Tổng cục Thuế để đảm bảo tính chính xác, minh bạch trong việc kê khai và hoàn thuế GTGT.