Công văn số 3635 TCT/ĐTNN được ban hành ngày 05/11/2004 bởi Tổng cục Thuế hướng dẫn chi tiết về chính sách thuế giá trị gia tăng (GTGT) đối với các dự án sử dụng nguồn vốn viện trợ không hoàn lại và viện trợ nhân đạo tại Việt Nam. Đây là văn bản hướng dẫn quan trọng giúp tháo gỡ các vướng mắc cho các chủ dự án, nhà thầu và cơ quan thuế địa phương trong việc áp dụng ưu đãi thuế.

1. Quy định về thuế GTGT đối với hàng hóa nhập khẩu viện trợ

• Hàng hóa được nhập khẩu vào Việt Nam bằng nguồn vốn viện trợ không hoàn lại hoặc viện trợ nhân đạo thuộc đối tượng không chịu thuế GTGT ở khâu nhập khẩu.
• Để được áp dụng chính sách không chịu thuế GTGT, đơn vị nhập khẩu phải xuất trình đầy đủ hồ sơ xác nhận viện trợ của cơ quan có thẩm quyền theo đúng quy định pháp luật về quản lý và sử dụng viện trợ nước ngoài.

2. Chính sách hoàn thuế GTGT đối với hàng hóa, dịch vụ mua trong nước

• Trường hợp chủ dự án viện trợ không hoàn lại hoặc nhà thầu chính được ủy quyền sử dụng nguồn vốn viện trợ không hoàn lại để mua hàng hóa, dịch vụ tại thị trường nội địa phục vụ cho việc thực hiện dự án thì được hoàn lại số thuế GTGT đã trả ghi trên hóa đơn mua hàng.
• Đối tượng được nộp hồ sơ hoàn thuế GTGT là chủ dự án viện trợ không hoàn lại hoặc văn phòng đại diện nhà tài trợ trực tiếp quản lý và thực hiện dự án.

3. Điều kiện và thủ tục hồ sơ đề nghị hoàn thuế GTGT

• Về hồ sơ pháp lý: Phải có quyết định phê duyệt dự án viện trợ không hoàn lại của cơ quan nhà nước có thẩm quyền và văn bản xác nhận viện trợ của Bộ Tài chính.
• Về chứng từ mua hàng: Phải cung cấp đầy đủ hóa đơn GTGT hợp pháp, trong đó ghi rõ thông tin đơn vị mua hàng là chủ dự án hoặc nhà thầu được ủy quyền, kèm theo bảng kê chi tiết hàng hóa, dịch vụ đã mua.
• Về chứng từ thanh toán: Phải có chứng từ thanh toán thực tế qua ngân hàng đối với các giao dịch mua hàng hóa, dịch vụ có giá trị lớn theo quy định của pháp luật thuế tại thời điểm phát sinh.

4. Trách nhiệm triển khai của cơ quan thuế địa phương

• Tổng cục Thuế yêu cầu các Cục Thuế tỉnh, thành phố trực thuộc Trung ương có trách nhiệm phổ biến, hướng dẫn các chủ dự án và tổ chức phi chính phủ thực hiện đúng quy trình kê khai, lập hồ sơ hoàn thuế GTGT.
• Cơ quan thuế có trách nhiệm kiểm tra, đối chiếu chặt chẽ giữa chứng từ mua hàng thực tế với nguồn vốn giải ngân từ viện trợ nhằm đảm bảo việc hoàn thuế đúng đối tượng, đúng mục đích và ngăn chặn các hành vi trục lợi chính sách thuế.