Công văn số 5285/TCHQ-KTTT do Tổng cục Hải quan ban hành nhằm hướng dẫn Cục Hải quan các tỉnh, thành phố thống nhất thực hiện việc xử lý thuế đối với mặt hàng thủy sản xuất khẩu nhưng bị đối tác nước ngoài trả lại và phải tái nhập khẩu vào Việt Nam. Đây là văn bản hướng dẫn quan trọng giúp tháo gỡ vướng mắc cho các doanh nghiệp ngành thủy sản khi gặp tình huống hàng hóa bị trả về.

Theo quy định tại Luật Thuế xuất khẩu, thuế nhập khẩu và Nghị định số 134/2016/NĐ-CP, Tổng cục Hải quan hướng dẫn cụ thể về việc áp dụng chính sách thuế đối với hàng hóa xuất khẩu phải tái nhập khẩu như sau:

• Trường hợp được miễn thuế nhập khẩu: Hàng hóa xuất khẩu đã nộp thuế xuất khẩu nhưng phải tái nhập khẩu được hoàn thuế xuất khẩu và không phải nộp thuế nhập khẩu nếu hàng hóa tái nhập để sửa chữa, tái chế sau đó tái xuất khẩu. Doanh nghiệp phải đăng ký tờ khai hải quan theo loại hình tái nhập phù hợp và tuân thủ thời hạn tái chế do cơ quan hải quan giám sát.
• Trường hợp không thu thuế nhập khẩu: Đối với hàng thủy sản tái nhập để tiêu thụ nội địa hoặc tiêu hủy (không tái xuất), doanh nghiệp phải kê khai nộp thuế nhập khẩu theo quy định đối với hàng hóa nhập khẩu thương mại thông thường, trừ các trường hợp được miễn thuế đặc biệt theo quy định pháp luật.
• Thủ tục hồ sơ: Doanh nghiệp cần cung cấp đầy đủ hồ sơ chứng minh hàng hóa tái nhập chính là hàng hóa đã xuất khẩu trước đó (bao gồm hợp đồng xuất khẩu, tờ khai xuất khẩu, văn bản thỏa thuận trả lại hàng của đối tác nước ngoài nêu rõ lý do trả hàng).

Về nghĩa vụ thuế GTGT đối với hàng thủy sản tái nhập, Tổng cục Hải quan hướng dẫn thực hiện theo quy định của Luật Thuế giá trị gia tăng và các văn bản hướng dẫn thi hành:

• Kê khai nộp thuế GTGT khâu nhập khẩu: Khi tái nhập khẩu hàng thủy sản bị trả lại, doanh nghiệp phải thực hiện kê khai và nộp thuế GTGT khâu nhập khẩu theo mức thuế suất quy định đối với mặt hàng thủy sản tương ứng tại thời điểm tái nhập khẩu.
• Xử lý thuế GTGT đã nộp khâu xuất khẩu: Trường hợp doanh nghiệp đã thực hiện hoàn thuế GTGT hoặc khấu trừ thuế GTGT đầu vào đối với lô hàng xuất khẩu trước đó, khi tái nhập khẩu phải thực hiện điều chỉnh, kê khai lại với cơ quan thuế nội địa quản lý trực tiếp theo đúng quy định của pháp luật về quản lý thuế.

Để đảm bảo việc quản lý thuế chặt chẽ, tránh thất thu ngân sách nhà nước đồng thời tạo điều kiện thuận lợi cho doanh nghiệp, Công văn yêu cầu:

• Đối với cơ quan hải quan địa phương: Thực hiện kiểm tra chặt chẽ hồ sơ hải quan, đối chiếu thông tin trên tờ khai xuất khẩu ban đầu và tờ khai tái nhập khẩu. Giám sát nghiêm ngặt quá trình tái chế, tiêu hủy hoặc chuyển mục đích sử dụng của lô hàng thủy sản tái nhập.
• Đối với doanh nghiệp: Chịu trách nhiệm trước pháp luật về tính chính xác, trung thực của các chứng từ, hồ sơ xuất trình cho cơ quan hải quan. Thực hiện đầy đủ nghĩa vụ tài chính và báo cáo quyết toán tình hình sử dụng hàng hóa tái nhập đúng thời hạn quy định.