Thông tư 278/2016/TT-BTC do Bộ trưởng Bộ Tài chính ban hành quy định chi tiết về mức thu, chế độ thu, nộp, quản lý và sử dụng phí trong lĩnh vực y tế, nhằm chuẩn hóa các khoản phí phát sinh trong hoạt động quản lý nhà nước về y tế.

Phạm vi điều chỉnh và đối tượng áp dụng

Thông tư này áp dụng đối với các tổ chức, cá nhân nộp phí; các cơ quan, tổ chức thực hiện thu phí trong lĩnh vực y tế; cùng các tổ chức, cá nhân khác có liên quan trực tiếp đến công tác thu, nộp, quản lý và sử dụng nguồn phí này trên phạm vi cả nước.

- Quy định về người nộp phí và tổ chức thu phí

• Người nộp phí: Là các tổ chức, cá nhân khi đề nghị cơ quan quản lý nhà nước có thẩm quyền thực hiện các công việc, dịch vụ công liên quan đến lĩnh vực y tế được quy định cụ thể tại Biểu phí ban hành kèm theo Thông tư này.
• Tổ chức thu phí: Bao gồm các cơ quan, đơn vị trực thuộc Bộ Y tế; các cơ quan, đơn vị thuộc Bộ Quốc phòng; và Sở Y tế các tỉnh, thành phố trực thuộc trung ương có thẩm quyền thực hiện các công việc quản lý nhà nước phát sinh phí.

- Mức thu phí trong lĩnh vực y tế

• Mức thu các loại phí cụ thể trong lĩnh vực y tế được thực hiện nghiêm ngặt theo quy định chi tiết tại Biểu phí ban hành kèm theo Thông tư này.

- Quy trình kê khai và nộp phí của tổ chức thu

• Thời hạn nộp tiền vào Kho bạc: Chậm nhất là ngày 05 hàng tháng, tổ chức thu phí có trách nhiệm gửi toàn bộ số tiền phí đã thu được của tháng trước vào tài khoản phí chờ nộp ngân sách mở tại Kho bạc Nhà nước.
• Kê khai và quyết toán: Tổ chức thu phí thực hiện kê khai, nộp số tiền phí thu được theo tháng và thực hiện quyết toán năm theo đúng hướng dẫn tại Thông tư số 156/2013/TT-BTC của Bộ trưởng Bộ Tài chính hướng dẫn thi hành Luật quản lý thuế.

- Nguyên tắc quản lý và sử dụng tiền phí thu được

• Đối với tổ chức thu phí thuộc Bộ Quốc phòng: Được trích lại 80% tổng số tiền phí thu được để trang trải chi phí cho các nội dung chi phục vụ công tác thu phí và hoạt động chuyên môn theo quy định tại Nghị định số 120/2016/NĐ-CP. Số tiền 20% còn lại phải nộp vào ngân sách nhà nước theo đúng mục lục ngân sách hiện hành.
• Đối với tổ chức thu phí thuộc Bộ Y tế và Sở Y tế các tỉnh, thành phố:
  • Trường hợp thông thường: Tổ chức thu phí phải nộp toàn bộ 100% số tiền phí thu được vào ngân sách nhà nước. Nguồn chi phí trang trải cho hoạt động thực hiện công việc và thu phí sẽ do ngân sách nhà nước bố trí trong dự toán hàng năm của đơn vị theo chế độ, định mức quy định.
  • Trường hợp đặc thù: Nếu tổ chức thu phí là cơ quan nhà nước được khoán chi phí hoạt động từ nguồn thu phí theo quy định tại Nghị định số 120/2016/NĐ-CP thì được trích lại 80% số tiền phí thu được để trang trải chi phí hoạt động; 20% còn lại nộp vào ngân sách nhà nước.

Hiệu lực thi hành và tổ chức thực hiện

Thông tư 278/2016/TT-BTC có hiệu lực thi hành kể từ ngày 01 tháng 01 năm 2017. Thông tư này thay thế hoàn toàn Thông tư số 03/2013/TT-BTC ngày 08 tháng 01 năm 2013 của Bộ trưởng Bộ Tài chính quy định về phí thẩm định kinh doanh thương mại có điều kiện; thẩm định tiêu chuẩn, điều kiện hành nghề y, dược; lệ phí cấp giấy phép xuất, nhập khẩu trang thiết bị y tế, dược phẩm, chứng chỉ hành nghề y, giấy phép hoạt động cơ sở khám, chữa bệnh.

Các nội dung khác liên quan đến chứng từ thu, công khai chế độ thu phí không quy định tại Thông tư này sẽ được thực hiện theo Luật phí và lệ phí, Nghị định số 120/2016/NĐ-CP và các văn bản hướng dẫn hiện hành của Bộ Tài chính. Trong quá trình thực hiện, nếu có vướng mắc phát sinh, các tổ chức, cá nhân cần kịp thời phản ánh về Bộ Tài chính để nghiên cứu, hướng dẫn bổ sung.