Ngày 14 tháng 05 năm 1999, Bộ trưởng Bộ Y tế đã ban hành Chỉ thị số 06/1999/CT-BYT về việc tăng cường công tác lưu trữ trong ngành y tế. Văn bản này tập trung vào việc chấn chỉnh, nâng cao hiệu quả quản lý, bảo quản và khai thác hồ sơ, tài liệu lưu trữ tại các cơ quan, đơn vị thuộc ngành y tế nhằm phục vụ tốt hơn cho công tác quản lý nhà nước và chuyên môn nghiệp vụ.

Phạm vi và đối tượng áp dụng: Chỉ thị áp dụng đối với các vụ, cục, văn phòng Bộ, các đơn vị sự nghiệp trực thuộc Bộ Y tế, Sở Y tế các tỉnh, thành phố trực thuộc Trung ương và các cơ sở y tế trên phạm vi cả nước.

Các nội dung cốt lõi của Chỉ thị bao gồm:

• Nâng cao nhận thức về vai trò của công tác lưu trữ: Thủ trưởng các cơ quan, đơn vị cần quán triệt sâu sắc tầm quan trọng của tài liệu lưu trữ y tế, coi đây là nguồn thông tin quý giá phục vụ công tác nghiên cứu khoa học, khám chữa bệnh và quản lý nhà nước trong lĩnh vực y tế.
• Kiện toàn tổ chức và bố trí cán bộ lưu trữ chuyên trách: Các đơn vị y tế có trách nhiệm bố trí cán bộ có đủ năng lực, trình độ chuyên môn làm công tác lưu trữ; đồng thời tổ chức đào tạo, bồi dưỡng nghiệp vụ thường xuyên cho đội ngũ làm công tác văn thư, lưu trữ tại cơ sở.
• Thu thập, chỉnh lý và bảo quản an toàn tài liệu: Thực hiện nghiêm túc việc thu thập hồ sơ, tài liệu vào lưu trữ cơ quan theo đúng quy định; tiến hành phân loại, chỉnh lý khoa học và trang bị đầy đủ phương tiện bảo quản như kho tàng, giá, tủ, trang thiết bị phòng chống cháy nổ, ẩm mốc để bảo vệ an toàn tài liệu.
• Xây dựng quy chế và danh mục hồ sơ lưu trữ: Ban hành quy chế công tác văn thư, lưu trữ cụ thể cho từng đơn vị; xây dựng danh mục hồ sơ cơ quan và bảng thời hạn bảo quản tài liệu chuyên ngành y tế để làm cơ sở cho việc phân loại, lưu trữ và tiêu hủy tài liệu hết giá trị theo đúng quy trình pháp luật.
• Tăng cường công tác kiểm tra, giám sát và báo cáo: Văn phòng Bộ Y tế phối hợp với các đơn vị liên quan chịu trách nhiệm thường xuyên kiểm tra, đôn đốc việc thực hiện Chỉ thị tại các cơ quan, đơn vị trong toàn ngành, kịp thời báo cáo Bộ trưởng những vướng mắc phát sinh.

Hiệu lực thi hành: Chỉ thị 06/1999/CT-BYT có hiệu lực kể từ ngày ký ban hành. Thủ trưởng các vụ, cục, đơn vị trực thuộc Bộ và Giám đốc Sở Y tế các tỉnh, thành phố trực thuộc Trung ương chịu trách nhiệm tổ chức triển khai và thi hành nghiêm túc các nội dung của Chỉ thị này.