Công văn 2503/TC/TCT do Bộ Tài chính ban hành hướng dẫn về chứng từ thanh toán qua ngân hàng đối với các hợp đồng xuất khẩu hàng hóa theo hình thức thanh toán trả chậm, làm cơ sở để khấu trừ hoặc hoàn thuế giá trị gia tăng (GTGT) đầu vào đối với hàng hóa xuất khẩu.

Văn bản này áp dụng đối với các doanh nghiệp có hoạt động xuất khẩu hàng hóa, dịch vụ thực hiện theo phương thức thanh toán trả chậm và các cơ quan thuế trực thuộc trong quá trình kiểm tra, giải quyết hồ sơ hoàn thuế GTGT.

• Hợp đồng xuất khẩu phải được ký kết bằng văn bản giữa doanh nghiệp Việt Nam và thương nhân nước ngoài.
• Trong hợp đồng xuất khẩu phải ghi rõ điều khoản thanh toán trả chậm, thời hạn thanh toán cụ thể và phương thức thanh toán qua ngân hàng phù hợp với quy định của pháp luật về quản lý ngoại hối.
• Thời hạn thanh toán trả chậm phải được thỏa thuận rõ ràng và thống nhất giữa các bên ký kết hợp đồng.

• Tại thời điểm kê khai, áp dụng thuế suất 0% hoặc lập hồ sơ đề nghị hoàn thuế GTGT, nếu chưa đến thời hạn thanh toán ghi trong hợp đồng xuất khẩu trả chậm, cơ sở kinh doanh chưa bắt buộc phải có chứng từ thanh toán qua ngân hàng.
• Thay vào đó, cơ sở kinh doanh phải xuất trình đầy đủ các chứng từ khác bao gồm: Hợp đồng xuất khẩu hàng hóa, Tờ khai hải quan đối với hàng hóa xuất khẩu đã có xác nhận thực xuất của cơ quan hải quan, và Hóa đơn thương mại.
• Cơ quan thuế sẽ căn cứ vào các chứng từ hợp lệ nêu trên để xem xét, giải quyết việc khấu trừ hoặc hoàn thuế GTGT tạm thời cho doanh nghiệp theo quy định.

• Khi đến thời hạn thanh toán ghi trong hợp đồng xuất khẩu trả chậm, doanh nghiệp xuất khẩu có trách nhiệm hoàn thiện hồ sơ bằng cách bổ sung chứng từ thanh toán qua ngân hàng gửi cho cơ quan thuế quản lý trực tiếp.
• Trường hợp phía nước ngoài thanh toán chậm so với thời hạn ghi trong hợp đồng do các nguyên nhân khách quan, doanh nghiệp phải có văn bản giải trình rõ lý do kèm theo các tài liệu chứng minh liên quan gửi cơ quan thuế.
• Nếu quá thời hạn thanh toán mà doanh nghiệp không xuất trình được chứng từ thanh toán qua ngân hàng và không có lý do chính đáng được chấp thuận, doanh nghiệp phải thực hiện kê khai điều chỉnh giảm số thuế GTGT đầu vào đã được khấu trừ hoặc hoàn trả lại số tiền thuế GTGT đã được hoàn tương ứng với phần giá trị hàng hóa không có chứng từ thanh toán.

• Cơ quan thuế các cấp có trách nhiệm theo dõi chặt chẽ các trường hợp hoàn thuế đối với hợp đồng xuất khẩu thanh toán trả chậm.
• Thực hiện thanh tra, kiểm tra sau hoàn thuế đối với các doanh nghiệp áp dụng hình thức thanh toán trả chậm nhằm ngăn chặn các hành vi gian lận, trục lợi tiền hoàn thuế từ ngân sách nhà nước.

Công văn này có hiệu lực thi hành kể từ ngày ban hành và hướng dẫn thống nhất cho các Cục Thuế tỉnh, thành phố trực thuộc Trung ương thực hiện, tạo điều kiện tháo gỡ khó khăn về vốn cho các doanh nghiệp xuất khẩu trong khi vẫn đảm bảo quản lý chặt chẽ nguồn thu ngân sách.