Tổng quan về Công văn 2688/TCT-CS năm 2024

Công văn 2688/TCT-CS do Tổng cục Thuế ban hành năm 2024 là văn bản hướng dẫn nghiệp vụ quan trọng liên quan đến chính sách hoàn thuế giá trị gia tăng (GTGT) đối với các dự án đầu tư theo phương thức đối tác công tư (PPP). Văn bản này tập trung tháo gỡ các vướng mắc thực tế của doanh nghiệp dự án PPP trong quá trình thực hiện thủ tục hoàn thuế, đảm bảo sự thống nhất trong việc áp dụng pháp luật thuế và pháp luật về đầu tư PPP trên phạm vi cả nước.

- Đối tượng áp dụng và phạm vi điều chỉnh

• Doanh nghiệp dự án PPP được thành lập hợp pháp để thực hiện hợp đồng dự án theo quy định của pháp luật về đầu tư theo phương thức đối tác công tư.
• Cơ quan thuế các cấp chịu trách nhiệm tiếp nhận, thẩm định và giải quyết hồ sơ hoàn thuế GTGT cho các dự án PPP.
• Các tổ chức, cá nhân có liên quan trực tiếp đến hoạt động đầu tư, xây dựng, vận hành và chuyển giao công trình thuộc dự án PPP.

- Nguyên tắc hoàn thuế GTGT đối với dự án đầu tư PPP

• Doanh nghiệp dự án PPP phải thực hiện đăng ký thuế, khai thuế GTGT theo phương pháp khấu trừ để làm cơ sở pháp lý cho việc xem xét hoàn thuế.
• Dự án đầu tư PPP phải là dự án đầu tư mới đang trong giai đoạn đầu tư, chưa đi vào hoạt động sản xuất kinh doanh và chưa đăng ký kinh doanh, đăng ký thuế (đối với trường hợp chi nhánh hoặc đơn vị phụ thuộc thực hiện).
• Số thuế GTGT đầu vào của hàng hóa, dịch vụ sử dụng cho dự án đầu tư PPP phát sinh trong giai đoạn đầu tư phải được hạch toán riêng biệt, rõ ràng và đáp ứng đầy đủ các điều kiện khấu trừ theo quy định của Luật Thuế giá trị gia tăng hiện hành.

- Điều kiện và hồ sơ đề nghị hoàn thuế GTGT

• Điều kiện về chứng từ: Doanh nghiệp phải cung cấp đầy đủ hóa đơn GTGT hợp pháp của hàng hóa, dịch vụ mua vào, cùng với chứng từ thanh toán không dùng tiền mặt đối với các giao dịch có giá trị từ 20 triệu đồng trở lên.
• Điều kiện về góp vốn: Doanh nghiệp dự án PPP phải thực hiện góp đủ vốn điều lệ theo đúng tiến độ đã cam kết trong Giấy chứng nhận đăng ký doanh nghiệp hoặc hợp đồng dự án PPP đã ký kết với cơ quan nhà nước có thẩm quyền.
• Hồ sơ hoàn thuế: Bao gồm Giấy đề nghị hoàn trả khoản thu ngân sách nhà nước (Mẫu số 01/HT ban hành kèm theo Thông tư hướng dẫn Luật Quản lý thuế), Hợp đồng dự án PPP ký kết với cơ quan nhà nước có thẩm quyền, Giấy chứng nhận đăng ký đầu tư và các tài liệu pháp lý liên quan khác.

- Một số lưu ý quan trọng khi thực hiện hoàn thuế cho dự án PPP

• Trường hợp dự án PPP được phân kỳ đầu tư hoặc chia thành nhiều giai đoạn thực hiện, việc xác định số thuế GTGT được hoàn phải căn cứ sát sao vào tiến độ thực tế và các điều khoản cụ thể được quy định trong hợp đồng dự án PPP.
• Doanh nghiệp cần lưu ý phân bổ và hạch toán chính xác thuế GTGT đầu vào dùng cho hoạt động sản xuất kinh doanh hàng hóa, dịch vụ chịu thuế và không chịu thuế GTGT (nếu có) trong suốt quá trình triển khai dự án.
• Cơ quan thuế sẽ áp dụng nguyên tắc quản lý rủi ro để thực hiện thanh tra, kiểm tra trước hoặc sau khi hoàn thuế, nhằm đảm bảo tính minh bạch, đúng đối tượng và phòng chống các hành vi gian lận trục lợi tiền hoàn thuế từ ngân sách nhà nước.

Tóm lại, hướng dẫn tại Công văn 2688/TCT-CS năm 2024 tạo cơ sở pháp lý vững chắc giúp khơi thông dòng vốn cho các nhà đầu tư, thúc đẩy tiến độ triển khai các dự án hạ tầng trọng điểm quốc gia theo phương thức PPP.