Ngày 18/8/2014, Tổng cục Thuế có công văn số 3343/TCT-CS về việc chính sách thuế hướng dẫn giải quyết hoàn thuế GTGT đối với trường hợp cơ sở kinh doanh đang hoạt động thuộc đối tượng nộp thuế GTGT theo phương pháp khấu trừ có dự án đầu tư mới tại địa bàn tỉnh, thành phố trực thuộc Trung ương khác với tỉnh, thành phố nơi đóng trụ sở chính theo báo cáo vướng mắc tại công văn 28536/CT-PC ngày 10/6/2014 và công văn 36910/CT-PC ngày 29/7/2014 của Cục Thuế Thành phố Hà Nội.

Theo hướng dẫn tại công văn 3343/TCT-CS ngày 18/8/2014 của Tổng cục Thuế: Trường hợp cơ sở kinh doanh đang hoạt động thuộc đối tượng nộp thuế GTGT theo phương pháp khấu trừ có dự án đầu tư mới (trừ dự án đầu tư xây dựng nhà để bán) tại địa bàn tỉnh, thành phố trực thuộc Trung ương khác với tỉnh, thành phố nơi đóng trụ sở chính, đang trong giai đoạn đầu tư chưa đi vào hoạt động, cơ sở kinh doanh đã thành lập chi nhánh, chi nhánh đã đăng ký thuế và được cấp mã số thuế, nhưng chi nhánh không quản lý dự án, dự án vẫn do cơ sở kinh doanh trực tiếp quản lý, chưa bàn giao cho chi nhánh, cơ sở kinh doanh đã và đang tiến hành kê khai riêng thuế GTGT đầu vào cho dự án trên Mẫu số 02/GTGT và lập hồ sơ xin hoàn thuế GTGT riêng đối với số thuế đầu vào của dự án thì cơ sở kinh doanh được xem xét, hoàn thuế GTGT đầu vào cho dự án đầu tư sau khi bù trừ với việc kê khai thuế GTGT của hoạt động sản xuất kinh doanh đang thực hiện.

Cục Thuế Thành phố Hà Nội sao gửi kèm theo công văn số 3343/TCT-CS ngày 18/8/2014 của Tổng cục thuế để các phòng, các Chi cục Thuế thực hiện theo quy định./.