Công văn 727/TCT-CS năm 2015 do Tổng cục Thuế ban hành nhằm hướng dẫn về chính sách thuế thu nhập doanh nghiệp (TNDN). Nội dung trọng tâm của văn bản giải quyết các vướng mắc liên quan đến việc kế thừa ưu đãi thuế TNDN khi doanh nghiệp có sự thay đổi về tên gọi, chủ sở hữu nhưng vẫn tiếp tục thực hiện dự án đầu tư ban đầu.

Theo quy định của pháp luật về thuế thu nhập doanh nghiệp và các văn bản hướng dẫn thi hành, Tổng cục Thuế đưa ra nguyên tắc xử lý đối với trường hợp doanh nghiệp thay đổi thông tin đăng ký doanh nghiệp:

• Trường hợp doanh nghiệp có sự thay đổi về thành viên góp vốn, cổ đông hoặc thay đổi chủ sở hữu nhưng dự án đầu tư thực tế vẫn được tiếp tục triển khai, không có sự thay đổi về quy mô, mục tiêu và địa điểm đầu tư thì doanh nghiệp mới (sau khi đổi tên, đổi chủ sở hữu) tiếp tục được hưởng ưu đãi thuế TNDN.
• Ưu đãi thuế TNDN được kế thừa bao gồm thuế suất ưu đãi, thời gian miễn thuế, giảm thuế cho thời gian ưu đãi còn lại của dự án đầu tư đó.
• Doanh nghiệp phải đảm bảo đáp ứng đầy đủ các điều kiện về ưu đãi thuế TNDN theo quy định tại thời điểm dự án được cấp phép hoặc thời điểm phát sinh ưu đãi thực tế.

Công văn đưa ra các hướng dẫn chi tiết nhằm tháo gỡ khó khăn cho doanh nghiệp trong quá trình chuyển nhượng, tái cơ cấu hoạt động sản xuất kinh doanh:

• Doanh nghiệp nhận chuyển nhượng hoặc thay đổi sở hữu có trách nhiệm tiếp tục thực hiện các nghĩa vụ thuế phát sinh và được kế thừa toàn bộ quyền lợi về ưu đãi thuế TNDN của dự án trước đó.
• Việc xác định thời gian miễn thuế, giảm thuế và thuế suất ưu đãi còn lại phải căn cứ sát sao vào thời gian thực tế mà dự án đã hoạt động và đã được hưởng ưu đãi trước khi thực hiện việc chuyển đổi.
• Doanh nghiệp có nghĩa vụ chủ động báo cáo, kê khai đầy đủ, kịp thời các thông tin thay đổi với cơ quan thuế quản lý trực tiếp để làm cơ sở theo dõi, áp dụng chính sách ưu đãi đúng quy định pháp luật.

Để đảm bảo việc áp dụng chính sách ưu đãi thuế TNDN đúng đối tượng, tránh việc lợi dụng chính sách để trốn thuế hoặc chuyển giá, Tổng cục Thuế yêu cầu Cục Thuế địa phương thực hiện các biện pháp quản lý chặt chẽ:

• Tiến hành thanh tra, kiểm tra và rà soát thực tế dự án đầu tư sau khi có sự thay đổi chủ sở hữu để xác định dự án có thực sự tiếp tục hoạt động theo đúng mục tiêu, quy mô ban đầu hay không.
• Trường hợp phát hiện doanh nghiệp có sự thay đổi về ngành nghề kinh doanh, mục tiêu đầu tư dẫn đến việc không còn đáp ứng các điều kiện ưu đãi thuế thì phải thực hiện điều chỉnh, đình chỉ ưu đãi hoặc truy thu thuế theo đúng quy định của pháp luật thuế hiện hành.