Công văn về việc khấu trừ thuế giá trị gia tăng (GTGT) là văn bản hướng dẫn nghiệp vụ thuế (hiện chưa rõ số hiệu, cơ quan ban hành và ngày ban hành cụ thể). Văn bản này tập trung giải quyết các vướng mắc, hướng dẫn chi tiết về nguyên tắc, điều kiện và các trường hợp đặc biệt liên quan đến việc khấu trừ thuế GTGT đầu vào của các tổ chức, cá nhân nộp thuế theo phương pháp khấu trừ.

Phạm vi và đối tượng áp dụng

Văn bản áp dụng đối với các cơ sở kinh doanh, doanh nghiệp nộp thuế GTGT theo phương pháp khấu trừ thuế và các cơ quan thuế trực tiếp quản lý, hướng dẫn thực hiện nghĩa vụ thuế.

Nguyên tắc khấu trừ thuế giá trị gia tăng đầu vào

• Thuế GTGT đầu vào của hàng hóa, dịch vụ dùng cho sản xuất, kinh doanh hàng hóa, dịch vụ chịu thuế GTGT được khấu trừ toàn bộ, bao gồm cả thuế GTGT đầu vào không được bồi thường của hàng hóa, dịch vụ chịu thuế GTGT bị tổn thất.
• Đối với hàng hóa, dịch vụ sử dụng đồng thời cho sản xuất, kinh doanh hàng hóa, dịch vụ chịu thuế và không chịu thuế GTGT, cơ sở kinh doanh phải hạch toán riêng thuế GTGT đầu vào được khấu trừ và không được khấu trừ. Trường hợp không hạch toán riêng được thì thuế đầu vào được khấu trừ tính theo tỷ lệ (%) giữa doanh thu chịu thuế GTGT so với tổng doanh thu của hàng hóa, dịch vụ bán ra.
• Thuế GTGT đầu vào của hàng hóa, dịch vụ hình thành tài sản cố định dùng cho mục đích phúc lợi cho người lao động như nhà ăn, nhà nghỉ giữa ca, nhà thay đồ, nhà vệ sinh, bể nước, nhà để xe được khấu trừ toàn bộ.

Điều kiện khấu trừ thuế giá trị gia tăng đầu vào

• Hóa đơn chứng từ hợp lệ: Phải có hóa đơn giá trị gia tăng hợp pháp của hàng hóa, dịch vụ mua vào hoặc chứng từ nộp thuế giá trị gia tăng khâu nhập khẩu, hoặc chứng từ nộp thuế GTGT thay cho phía nước ngoài theo hướng dẫn của Bộ Tài chính.
• Chứng từ thanh toán không dùng tiền mặt: Có chứng từ thanh toán không dùng tiền mặt đối với hàng hóa, dịch vụ mua vào (bao gồm cả hàng hóa nhập khẩu) từ hai mươi triệu đồng trở lên (giá đã bao gồm thuế GTGT).
• Phương thức thanh toán qua ngân hàng: Chứng từ thanh toán qua ngân hàng được hiểu là có sự chuyển tiền từ tài khoản của bên mua sang tài khoản của bên bán mở tại các tổ chức cung ứng dịch vụ thanh toán theo các hình thức thanh toán phù hợp với quy định của pháp luật hiện hành.

Các trường hợp không được khấu trừ thuế giá trị gia tăng đầu vào

• Hóa đơn GTGT không đúng quy định của pháp luật, ví dụ như hóa đơn không ghi thuế GTGT (trừ trường hợp đặc thù), hóa đơn không có giá trị sử dụng, hóa đơn bị tẩy xóa hoặc hóa đơn khống.
• Hóa đơn không ghi hoặc ghi không đúng tên, địa chỉ, mã số thuế của người mua nên không xác định được người mua hàng.
• Chứng từ thanh toán không dùng tiền mặt không đáp ứng đủ các điều kiện theo quy định của pháp luật đối với các giao dịch từ hai mươi triệu đồng trở lên.

Hiệu lực thi hành

Do thông tin về ngày ban hành và ngày áp dụng của công văn chưa được xác định rõ ràng, người nộp thuế cần chủ động liên hệ với cơ quan thuế quản lý trực tiếp hoặc đối chiếu với các văn bản quy phạm pháp luật hiện hành (như Luật Thuế giá trị gia tăng và các Thông tư hướng dẫn liên quan) để áp dụng đúng quy định pháp luật tại thời điểm phát sinh giao dịch.