Công văn 3415/TCT-KK năm 2016 do Tổng cục Thuế ban hành gửi Cục Thuế thành phố Hải Phòng đưa ra hướng dẫn cụ thể về việc giải quyết hồ sơ hoàn thuế giá trị gia tăng (GTGT) đối với dự án đầu tư đã đi vào hoạt động và phát sinh doanh thu, căn cứ trên quy định tại Thông tư 219/2013/TT-BTC.

- Quy định về điều kiện khấu trừ thuế giá trị gia tăng đầu vào

Căn cứ theo Điều 15 Thông tư số 219/2013/TT-BTC, cơ sở kinh doanh muốn khấu trừ thuế GTGT đầu vào phải đáp ứng đầy đủ các điều kiện sau:

• Hóa đơn, chứng từ hợp pháp: Có hóa đơn GTGT hợp pháp của hàng hóa, dịch vụ mua vào hoặc chứng từ nộp thuế GTGT khâu nhập khẩu, hoặc chứng từ nộp thuế GTGT thay cho phía nước ngoài đối với tổ chức, cá nhân nước ngoài không có tư cách pháp nhân Việt Nam kinh doanh/có thu nhập tại Việt Nam.
• Chứng từ thanh toán không dùng tiền mặt: Áp dụng đối với hàng hóa, dịch vụ mua vào (bao gồm cả hàng hóa nhập khẩu) có giá trị từ 20 triệu đồng trở lên (giá đã bao gồm thuế GTGT), trừ các trường hợp ngoại lệ theo quy định. Chứng từ thanh toán không dùng tiền mặt bao gồm chứng từ qua ngân hàng và các hình thức hợp pháp khác.

- Quy định về các trường hợp được hoàn thuế giá trị gia tăng

Tổng cục Thuế viện dẫn các quy định tại Điều 18 Thông tư số 219/2013/TT-BTC để phân định rõ hai trường hợp hoàn thuế GTGT:

• Hoàn thuế theo kỳ lũy kế (Khoản 1 Điều 18): Cơ sở kinh doanh nộp thuế theo phương pháp khấu trừ có số thuế GTGT đầu vào chưa được khấu trừ hết trong tháng hoặc quý thì được khấu trừ vào kỳ tiếp theo. Trường hợp lũy kế sau ít nhất 12 tháng (đối với kê khai theo tháng) hoặc ít nhất 04 quý (đối với kê khai theo quý) tính từ tháng/quý đầu tiên phát sinh số thuế chưa được khấu trừ hết mà vẫn còn thuế chưa khấu trừ hết thì được xét hoàn thuế.
• Hoàn thuế đối với dự án đầu tư (Khoản 2 Điều 18): Áp dụng cho cơ sở kinh doanh mới thành lập từ dự án đầu tư hoặc dự án đang trong giai đoạn đầu tư, chưa đi vào hoạt động. Nếu thời gian đầu tư từ 01 năm trở lên hoặc có số thuế GTGT lũy kế của hàng hóa, dịch vụ mua cho đầu tư từ 300 triệu đồng trở lên thì được hoàn thuế GTGT theo dự án đầu tư.

- Hướng dẫn xử lý hoàn thuế cụ thể cho Công ty TNHH Daesun Vina

Căn cứ vào tình hình thực tế hồ sơ của Công ty TNHH Daesun Vina:

• Doanh nghiệp có số thuế đầu vào chưa khấu trừ hết trên Tờ khai 01/GTGT âm liên tục từ quý IV/2015 đến quý I/2016 là -5.102.188.784 đồng.
• Doanh nghiệp có số thuế đầu vào chưa khấu trừ hết trên Tờ khai 02/GTGT từ quý I/2015 đến quý III/2015 là -4.822.439.121 đồng.
• Xét điều kiện hoàn dự án đầu tư: Từ quý IV/2015, dự án đầu tư của Công ty đã đi vào hoạt động và đã phát sinh doanh thu. Do đó, Công ty không đủ điều kiện hoàn thuế GTGT theo trường hợp dự án đầu tư (Khoản 2 Điều 18).
• Xử lý hoàn thuế theo trường hợp lũy kế: Công ty thuộc đối tượng được xem xét hoàn thuế theo hướng dẫn tại Khoản 1 Điều 18 Thông tư số 219/2013/TT-BTC (xét theo kỳ lũy kế âm liên tục) nếu đáp ứng đầy đủ điều kiện về hóa đơn và chứng từ thanh toán không dùng tiền mặt quy định tại Điều 15 Thông tư số 219/2013/TT-BTC.

- Trách nhiệm thi hành của Cục Thuế địa phương

Tổng cục Thuế giao Cục Thuế thành phố Hải Phòng trực tiếp kiểm tra, rà soát hồ sơ hoàn thuế của Công ty TNHH Daesun Vina. Trường hợp doanh nghiệp đáp ứng đầy đủ các điều kiện nêu trên thì thực hiện giải quyết hoàn thuế GTGT theo đúng quy định của pháp luật.