Công văn số 5415/TCT-CS do Tổng cục Thuế ban hành nhằm chỉ đạo và hướng dẫn Cục Thuế các tỉnh, thành phố trực thuộc Trung ương thực hiện các biện pháp tăng cường quản lý, đẩy nhanh tiến độ giải quyết hồ sơ hoàn thuế giá trị gia tăng (GTGT), đồng thời kiểm soát chặt chẽ để phòng chống gian lận, trục lợi tiền hoàn thuế từ ngân sách nhà nước.

Phạm vi và đối tượng áp dụng

Văn bản hướng dẫn áp dụng đối với cơ quan thuế các cấp bao gồm Cục Thuế, Chi cục Thuế và các công chức thuế trực tiếp tham gia vào quy trình tiếp nhận, phân loại, giải quyết hồ sơ hoàn thuế GTGT. Đối tượng chịu tác động gián tiếp là các doanh nghiệp, tổ chức có phát sinh hồ sơ đề nghị hoàn thuế GTGT đối với dự án đầu tư, hàng hóa xuất khẩu hoặc các trường hợp hoàn thuế khác theo quy định của pháp luật.

Đẩy nhanh tiến độ giải quyết hồ sơ hoàn thuế GTGT

• Yêu cầu các Cục Thuế tập trung nguồn lực, khẩn trương rà soát và phân loại hồ sơ hoàn thuế để giải quyết kịp thời cho người nộp thuế theo đúng thời hạn quy định của Luật Quản lý thuế.
• Đối với các hồ sơ thuộc diện hoàn thuế trước kiểm tra sau, nếu qua đối chiếu thông tin không phát hiện rủi ro thì phải ban hành quyết định hoàn thuế ngay cho doanh nghiệp, không được kéo dài thời gian xử lý một cách vô lý.
• Tăng cường ứng dụng công nghệ thông tin trong việc tiếp nhận và xử lý hồ sơ hoàn thuế tự động, giúp rút ngắn thời gian và minh bạch hóa quy trình giải quyết.

Tăng cường công tác thanh tra, kiểm tra và quản lý rủi ro

• Áp dụng triệt để tiêu chí quản lý rủi ro để phân loại hồ sơ hoàn thuế. Những hồ sơ có dấu hiệu rủi ro cao về thuế, hóa đơn hoặc có giao dịch đáng ngờ phải được đưa vào diện kiểm tra trước hoàn thuế sau.
• Tập trung kiểm tra, xác minh kỹ lưỡng các yếu tố đầu vào cấu thành nên số thuế đề nghị hoàn, đặc biệt là tính hợp pháp của hóa đơn mua vào và nguồn gốc hàng hóa từ các doanh nghiệp trung gian trong chuỗi cung ứng.
• Kiểm soát chặt chẽ các trường hợp hoàn thuế đối với hàng hóa xuất khẩu qua biên giới đất liền, các mặt hàng có rủi ro cao như nông, lâm, thủy hải sản, linh kiện điện tử.

Phối hợp liên ngành trong xác minh và xử lý vi phạm

• Cơ quan thuế chủ động phối hợp với cơ quan Hải quan để đối chiếu dữ liệu tờ khai xuất khẩu, thông tin thông quan hàng hóa và dòng tiền thanh toán qua ngân hàng.
• Tăng cường phối hợp với cơ quan Công an và các cơ quan chức năng khác để xác minh tính xác thực của các giao dịch mua bán trong nước và quốc tế khi phát hiện dấu hiệu thành lập doanh nghiệp "ma" để mua bán hóa đơn, trục lợi tiền hoàn thuế.
• Trường hợp phát hiện hành vi vi phạm có dấu hiệu tội phạm, cơ quan thuế phải kịp thời chuyển hồ sơ sang cơ quan điều tra để truy cứu trách nhiệm hình sự theo quy định của pháp luật.

Nâng cao kỷ cương, kỷ luật công vụ và trách nhiệm của công chức thuế

• Xác định rõ trách nhiệm của Thủ trưởng cơ quan thuế các cấp và công chức được giao nhiệm vụ giải quyết hồ sơ hoàn thuế. Người đứng đầu phải chịu trách nhiệm toàn diện nếu để xảy ra tình trạng chậm trễ, gây phiền hà cho doanh nghiệp hoặc để xảy ra sai phạm, thất thoát ngân sách.
• Nghiêm cấm mọi hành vi nhũng nhiễu, tự ý đặt ra các thủ tục, điều kiện ngoài quy định pháp luật làm khó dễ cho người nộp thuế.
• Thực hiện công tác kiểm tra, giám sát nội bộ thường xuyên đối với quy trình hoàn thuế để kịp thời phát hiện và chấn chỉnh các sai phạm của công chức thuế.

Hiệu lực thi hành

Công văn số 5415/TCT-CS có hiệu lực thi hành kể từ ngày ban hành. Các hướng dẫn trong văn bản này là cơ sở pháp lý và nghiệp vụ quan trọng để cơ quan thuế các cấp thống nhất thực hiện, vừa bảo đảm quyền lợi chính đáng của doanh nghiệp tuân thủ tốt pháp luật, vừa bảo vệ an toàn nguồn thu ngân sách nhà nước.